Zobrazit minimální záznam

Studie mechanismů aktivace DNA senzoru p204 během infekce myším polyomavirem
dc.contributor.advisorHuerfano Meneses, Sandra
dc.creatorJauce, Czech
dc.date.accessioned2024-12-01T22:59:32Z
dc.date.available2024-12-01T22:59:32Z
dc.date.issued2024
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/194057
dc.description.abstractProtein 204 (p204), myší ortolog lidského interferonem indukovatelného proteinu 16 (IFI16), je klíčový senzor DNA, který aktivuje produkci interferonů typu I prostřednictvím stimulátoru interferonem podmíněných genů (STING). p204 detekuje DNA myšího polyomaviru (MPyV), avšak molekulární mechanismus vedoucí k aktivaci STING nebyl popsán. Pro lepší pochopení signalizace p204 byl využit plazmid kódující p204 fúzovaný se zesíleným zeleným fluorescenčním proteinem (EGFP). p204 i p204-EGFP se lokalizovaly v jadérku a jádře, kde interagovaly s velkým T antigenem MPyV (LT), avšak pouze p204 byl přítomen v cytosolu. Výsledky qPCR naznačily, že nadměrná exprese p204-EGFP neindukovala interferonovou odpověď během infekce MPyV. Proto se pokračovalo v experimentech s endogenním p204. Konfokální mikroskopie naznačila mírné interakce p204 s fosforylovaným nádor tlumícím proteinem 53 (pp53), STING a faktorem 6 asociovaným s receptorem nádorového nekrotického faktoru (TRAF6) a silnější interakce STING s pp53, TRAF6 a ubiquitinem. Metoda proximální ligace (PLA) potvrdila mírné interakce, které byly hojnější v infikovaných buňkách. Role TRAF6 v zprostředkování interakcí p204 se STING a pp53 a v ubiquitinaci STING byla zkoumána pomocí buněčné linie neexprimující TRAF6. Výsledky PLA naznačily, že absence TRAF6...cs_CZ
dc.description.abstractThe protein 204 (p204), murine ortholog of human Interferon-inducible protein 16 (IFI16) is a key DNA sensor which activates Type I interferon production via stimulator of interferon genes (STING). The p204 detects mouse polyomavirus (MPyV) DNA, though the molecular mechanism leading to STING activation has not been described. To better understand p204's signaling, we used a plasmid encoding p204 fused to enhanced green fluorescent protein (EGFP). Both p204 and p204-EGFP localized in the nucleolus and nucleus, interacting with MPyV large T antigen (LT), but only p204 was present in the cytosol. qPCR results indicated that p204-EGFP overexpression did not induce an interferon response during MPyV infection. Therefore, we continued the experiments following the endogenous p204. Confocal microscopy suggested moderate interactions of p204 with phosphorylated tumor protein 53 (pp53), STING and tumor necrosis factor receptor-associated factor 6 (TRAF6) and stronger interactions of STING with pp53, TRAF6 and ubiquitin. Proximity ligation assay (PLA) confirmed the moderate interactions which were more abundant in infected cells. The role of TRAF6 in mediating p204's interactions with STING and pp53, and in STING ubiquitination, was examined using a TRAF6 knockout cell line. PLA results suggested that the...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectp204en_US
dc.subjectSTINGen_US
dc.subjectmouse polyomavirusen_US
dc.subjectinterferon responseen_US
dc.subjectcolocalizationen_US
dc.subjectprotein-protein interactionsen_US
dc.subjectpp53en_US
dc.subjectTRAF6en_US
dc.subjectp204cs_CZ
dc.subjectSTINGcs_CZ
dc.subjectmyší polyomaviruscs_CZ
dc.subjectinterferonová odpověďcs_CZ
dc.subjectkolokalizacecs_CZ
dc.subjectprotein-proteinové interakcecs_CZ
dc.subjectpp53cs_CZ
dc.subjectTRAF6cs_CZ
dc.titleStudies on the mechanisms of activation of the DNA sensor p204 during Mouse polyomavirus infectionen_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2024
dcterms.dateAccepted2024-09-11
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId241863
dc.title.translatedStudie mechanismů aktivace DNA senzoru p204 během infekce myším polyomaviremcs_CZ
dc.contributor.refereeKanwal, Madiha
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineVirologyen_US
thesis.degree.disciplineVirologiecs_CZ
thesis.degree.programGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
thesis.degree.programGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Genetics and Microbiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csVirologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enVirologyen_US
uk.degree-program.csGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
uk.degree-program.enGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csProtein 204 (p204), myší ortolog lidského interferonem indukovatelného proteinu 16 (IFI16), je klíčový senzor DNA, který aktivuje produkci interferonů typu I prostřednictvím stimulátoru interferonem podmíněných genů (STING). p204 detekuje DNA myšího polyomaviru (MPyV), avšak molekulární mechanismus vedoucí k aktivaci STING nebyl popsán. Pro lepší pochopení signalizace p204 byl využit plazmid kódující p204 fúzovaný se zesíleným zeleným fluorescenčním proteinem (EGFP). p204 i p204-EGFP se lokalizovaly v jadérku a jádře, kde interagovaly s velkým T antigenem MPyV (LT), avšak pouze p204 byl přítomen v cytosolu. Výsledky qPCR naznačily, že nadměrná exprese p204-EGFP neindukovala interferonovou odpověď během infekce MPyV. Proto se pokračovalo v experimentech s endogenním p204. Konfokální mikroskopie naznačila mírné interakce p204 s fosforylovaným nádor tlumícím proteinem 53 (pp53), STING a faktorem 6 asociovaným s receptorem nádorového nekrotického faktoru (TRAF6) a silnější interakce STING s pp53, TRAF6 a ubiquitinem. Metoda proximální ligace (PLA) potvrdila mírné interakce, které byly hojnější v infikovaných buňkách. Role TRAF6 v zprostředkování interakcí p204 se STING a pp53 a v ubiquitinaci STING byla zkoumána pomocí buněčné linie neexprimující TRAF6. Výsledky PLA naznačily, že absence TRAF6...cs_CZ
uk.abstract.enThe protein 204 (p204), murine ortholog of human Interferon-inducible protein 16 (IFI16) is a key DNA sensor which activates Type I interferon production via stimulator of interferon genes (STING). The p204 detects mouse polyomavirus (MPyV) DNA, though the molecular mechanism leading to STING activation has not been described. To better understand p204's signaling, we used a plasmid encoding p204 fused to enhanced green fluorescent protein (EGFP). Both p204 and p204-EGFP localized in the nucleolus and nucleus, interacting with MPyV large T antigen (LT), but only p204 was present in the cytosol. qPCR results indicated that p204-EGFP overexpression did not induce an interferon response during MPyV infection. Therefore, we continued the experiments following the endogenous p204. Confocal microscopy suggested moderate interactions of p204 with phosphorylated tumor protein 53 (pp53), STING and tumor necrosis factor receptor-associated factor 6 (TRAF6) and stronger interactions of STING with pp53, TRAF6 and ubiquitin. Proximity ligation assay (PLA) confirmed the moderate interactions which were more abundant in infected cells. The role of TRAF6 in mediating p204's interactions with STING and pp53, and in STING ubiquitination, was examined using a TRAF6 knockout cell line. PLA results suggested that the...en_US
uk.file-availabilityN
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
thesis.grade.code1
dc.contributor.consultantHorníková, Lenka
uk.publication-placePrahacs_CZ
dc.date.embargoEndDate11-09-2026
uk.embargo.reasonProtection of information protected by a special lawen
uk.embargo.reasonOchrana informací chráněných zvláštním zákonemcs
uk.thesis.defenceStatusO


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV