Studium mikroRNA u pacientů se spinocelulárními karcinomy hlavy a krku

Abstract

Hledání markerů nemocí je v popředí vědeckého zájmu. Biomarker specifické nemoci by měl sloužit jako pomocník při léčbě dané nemoci - ať už pro diagnostiku onemocnění nebo pro prognózu jejího průběhu. V naší studii jsme se zaměřili na využití mikroRNA - krátkých RNA, které svým nasedáním na mRNA regulují průběh exprese jednotlivých proteinů. MiRNA jsou předmětem studia díky jejich stabilitě a funkci v regulaci mnoha buněčných procesů. V neposlední řadě mají možné uplnatění jako biomarker u mnoha onemocnění. V našem případě to jsou spinocelulární nádory hlavy a krku (HNSCC). Jelikož je tento druh nádorového onemocnění široce rozšířen a klinicky významné markery zde chybí, je naším zájmem hledat nové druhy markerů, umožňujících včasnou diagnostiku nemoci a co nejpřesnější stanovení prognózy. Vybrali jsme 3 kandidátní miRNA (miR-29c-3p, miR-200b-5p, miR-375-3p), u kterých jsme metodou qRT-PCR provedli profilaci jejich expresí ve tkáních pacientů s HNSCC. Expresi miRNA ve 42 vzorcích nádorové tkáně jsme porovnali s expresí miRNA ve tkáních přiléhajících k nádoru. Tkáň obklopující nádor je zajímavá z hlediska svých vlastností, histologicky vypadá jako tkáň zdravá, ale při bližším zkoumání tomu tak není. Je ovlivněna tkání nádorovou a může přispívat k progresi nádoru. Podařilo se nám rozlišit tyto dvě...

Searching for markers of disease is at the forefront of scientific interest. Biomarker of a specific disease should help in disease management - whether for diagnosing a disease or predicting its progress. We picked microRNAs - short RNAs that regulate mRNA translation, due to their stability and function in the regulation of many cellular processes. Therefore they can be used as a biomarker for many diseases. In our study we focused on neck squamous cell carcinoma (HNSCC), since this type of cancer is widespread and clinically important markers are missing. It is in our interest to seek new kinds of markers, suitable for early diagnosis of the disease and the most accurate assessment of prognosis. We selected 3 candidate miRNA (miR-29c-3p, miR-200b-5p, miR-375-3p) and used qRT-PCR method to profile their expression in tissues of patients with HNSCC. MiRNA expressions in 42 tumor samples were compared with the miRNA expression in adjacent tissue of the tumor. Adjacent tissue surrounds the tumor and has interesting properties, as it looks like a histological normal tissue, but on closer inspection it is not. It is affected by tumor tissue and may contribute to tumor progression. We managed to distinguish between these two tissues using miR-29c-3p and miR-375-3p. Additional analyzes were focused on...