Evoluční a demografická historie arabských chameleonů

Abstract

In terms of chameleon biogeography, only the genus Chamaeleo occurs on the Arabian Peninsula, represented by three species: C. calyptratus, C. arabicus, and C. chamaeleon. Chamaeleo chamaeleon has the largest range, extending into North Africa and Southern Europe. In contrast, C. calyptratus and C. arabicus occur naturally only on the Arabian Peninsula. While the phylogeny of C. chamaeleon has been the subject of numerous scientific publications, the Arabian endemic species C. arabicus has not yet been comprehensively described using molecular genetic methods. For the purposes of this thesis, a phylogenetic tree was therefore constructed based on 121 individuals, more than fifty of which comprised the original dataset. Analyses were performed using three nuclear (ACM4, MC1R, PRLR) and three mitochondrial (ND2, COI, 16S) markers. Phylogenetic relationships were reconstructed using Maximum Likelihood (ML) and Bayesian Inference (BI). A calibrated phylogenetic tree was subsequently generated to estimate intraspecific divergence times, Skyline Plot analyses were used to characterise historical population changes, and haplotype networks were constructed to clarify genetic relationships among lineages and samples. Based on the results, it was found that the diversification of C. arabicus and C....

V rámci biogeografie chameleonů se na Arabském poloostrově vyskytuje pouze rod Chamaeleo, zastoupený třemi druhy: Ch. calyptratus, Ch. arabicus a Ch. chamaeleon. Největší areál rozšíření má Ch. chamaeleon, jehož výskyt zasahuje až na území severní Afriky a jižní Evropy. Naopak Ch. calyptratus a Ch. arabicus se přirozeně vyskytují jen na Arabském poloostrově. Zatímco fylogenezi druhu Ch. chamaeleon se věnuje řada odborných publikací, arabský endemický druh Ch. arabicus nebyl dosud komplexně popsán na základě molekulární genetiky. Pro účely diplomové práce byl proto vytvořen fylogenetický strom založený na 121 jedincích, z toho více než padesát vzorků tvořilo vlastní příspěvek. Analýzy byly provedeny na základě tří jaderných (ACM4, MC1R, PRLR) a tří mitochondriálních (ND2, COI, 16S) markerů. Fylogenetické vztahy byly zkonstruovány pomocí metod analýzy maximální věrohodnosti (ML) a Bayesovské analýzy (BI). Poté byl sestrojen kalibrovaný fylogenetický strom pro stanovení vnitrodruhových divergencí, analýzy Skyline Plots pro popis historických populačních změn a haplotypové sítě pro objasnění vzájemných genetických vztahů. Na základě výsledků bylo zjištěno, že k diverzifikaci druhů Ch. arabicus a Ch. chamaeleon došlo v období pleistocénu, ve kterém docházelo ke klimatickým změnám spojeným se střídáním...