Riziko celiakie v asociaci s viry lidského střeva

Abstract

Celiakie je chronické multifaktoriální imunopatologické onemocnění, které se nejčastěji rozvíjí již v dětství, a to u osob s genetickými predispozicemi při konzumaci lepku. Ovšem jen u malé části lidí s genetickým rizikem se celiakie rozvine. V rozvoji nemoci mohou hrát klíčovou roli faktory prostředí, jimiž mohou být například infekce nebo výživa. Za významné kandidáty v patogenezi celiakie se považují virové infekce. V mé předchozí práci jsem se již zabývala asociací střevních enterovirových a adenovirových infekcí s následným zvýšeným rizikem rozvoje celiakie. Ovšem roli v patogenezi celiakie by mohly hrát také parechoviry, které jsme schopni ve vzorcích taktéž detekovat s vysokou citlivostí a určit jejich genotypy. Navíc díky rozvoji metagenomických sekvenačních metod bylo možné otestovat i asociaci složení střevního DNA viromu, tedy souboru všech střevních DNA virů, především bakteriofágů, s následným rozvojem celiakie. V norské prospektivní novorozenecké kohortě MIDIA se podařilo prokázat signifikantně vyšší riziko pozdější celiakie u dětí s vyšší frenkvencí střevních parechovirových infekcí. Ve dvou významných prospektivních novorozeneckých kohortách, norské MIDIA a finské DIPP, jsme zanalyzovali více než 2 tisíce viromů a klasifikovali a anotovali nové viry na základě virové temné hmoty....

Celiac disease (CD) is a chronic multifactorial immune-mediated disorder that most often develops during infancy in genetically predisposed subjects consuming gluten. However, only a small proportion of individuals with a genetic risk develops CD, as environmental factors might be crucial for the development of the disease. For instance, infections or diet can play a role. Viral infections are considered to be important candidates in the pathogenesis of CD. In my previous work, I have already studied the association of gut enterovirus and adenovirus infections with the subsequent CD. In addition, parechovirus, which we were also able to detect with high sensitivity and genotyped them in samples, could also play a role in the pathogenesis of CD. Moreover, thanks to the development of metagenomic sequencing methods, we were able to test the association of the gut DNA virome (the set of all gut DNA viruses, especially bacteriophages) with the subsequent development of CD. In the Norwegian prospective birth cohort MIDIA, we observed a significantly higher frequency of parechovirus gut infections before CD development. Within two large prospective birth cohorts, Norwegian MIDIA and Finnish DIPP, we have analyzed more than 2000 viromes and classified novel viruses based on virus dark matter. No...