Zobrazit minimální záznam

Vliv nerovnoměrné rychlosti vzniku mutací na adaptivní evoluci
dc.contributor.advisorRozhoňová, Hana
dc.creatorJasková, Barbora
dc.date.accessioned2025-07-08T10:51:12Z
dc.date.available2025-07-08T10:51:12Z
dc.date.issued2025
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/200237
dc.description.abstractTitle: The Influence of Mutation Bias on Adaptive Evolution Author: Barbora Jasková Department: Department of Cell Biology Supervisor: Dr. Hana Rozhoňová Abstract: In evolutionary biology, natural selection acts upon genetic variation, which arises through mutations. However, mutations do not happen with equal probability, their occurrence is shaped by mutation biases; for example, a general tendency to favour transitions over transversions, or to prefer substitutions towards AT rather than GC. Recent studies clearly document that such biases are not overridden by natural selection but can influence the direction of adaptive evolution. Studies explored in this thesis have shown that the spectrum of adaptive substitutions can be predicted from the mutation spectrum, and even vice versa. Many underlying biases however remain unknown or unexplored. In this thesis, we investigate whether the structure of the genetic code introduces a mutation bias that influences the frequency of adaptive substitutions. We hypothesised that changes accessible through a greater number of single-nucleotide substitutions would occur more frequently among adaptive mutations. To test this, we applied correlation analyses and a negative binomial model to a dataset of antibiotics resistance-conferring substitutions in Mycobacterium...en_US
dc.description.abstractNázev práce: Vliv nerovnoměrné rychlosti vzniku mutací na adaptivní evoluci Autor: Barbora Jasková Katedra: Katedra buněčné biologie Vedoucí: Dr. Hana Rozhoňová Abstrakt: Základním mechanismem evoluční biologie je přirozený výběr, který vybírá nejvýhodnější varianty v rámci genetické variability, jež je tvořena mutacemi. Mutace však nevznikají zcela náhodně se stejnou pravděpodobností, naopak, jejich výskyt je ovlivněn tzv. mutačními biasy, tedy různými tendencemi mutačních mechanismů, například obecnou preferencí tranzic před transverzemi nebo substitucemi na AT před GC. Současné studie demonstrují, že tyto nerovnoměrnosti nejsou přirozeným výběrem potlačeny, ale ovlivňují směr adaptivní evoluce. Články shrnuté v této bakalářské práci ukazují, že se z mutačního spektra dá vyvodit spektrum adaptivních substitucí, a dokonce i naopak. Mnoho mutačních biasů však zatím není objeveno či prozkoumáno. V této práci jsme si položily otázku, zda samotná struktura genetického kódu nezavádí další mutační tendenci, která ovlivňuje poměr adaptivních substitucí. Předpokládaly jsme, že změny dosažitelné větším počtem jedno-nukleotidových substitucí se budou mezi adaptivními mutacemi vyskytovat častěji. Tento předpoklad jsme testovaly pomocí korelační analýzy a negativně binomického modelu na datasetu substitucí vedoucích k...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectmutation biasen_US
dc.subjectgenetic codeen_US
dc.subjectadaptive evolutionen_US
dc.subjectMycobacterium tuberculosisen_US
dc.subjectmutation biascs_CZ
dc.subjectgenetický kódcs_CZ
dc.subjectadaptivní evolucecs_CZ
dc.subjectMycobacterium tuberculosiscs_CZ
dc.titleThe Influence of Mutation Bias on Adaptive Evolutionen_US
dc.typebakalářská prácecs_CZ
dcterms.created2025
dcterms.dateAccepted2025-06-17
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId277872
dc.title.translatedVliv nerovnoměrné rychlosti vzniku mutací na adaptivní evolucics_CZ
dc.contributor.refereeBohutínská, Magdalena
thesis.degree.nameBc.
thesis.degree.levelbakalářskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBioinformaticsen_US
thesis.degree.disciplineBioinformatikacs_CZ
thesis.degree.programBioinformatikacs_CZ
thesis.degree.programBioinformaticsen_US
uk.thesis.typebakalářská prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Cell Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBioinformatikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBioinformaticsen_US
uk.degree-program.csBioinformatikacs_CZ
uk.degree-program.enBioinformaticsen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csNázev práce: Vliv nerovnoměrné rychlosti vzniku mutací na adaptivní evoluci Autor: Barbora Jasková Katedra: Katedra buněčné biologie Vedoucí: Dr. Hana Rozhoňová Abstrakt: Základním mechanismem evoluční biologie je přirozený výběr, který vybírá nejvýhodnější varianty v rámci genetické variability, jež je tvořena mutacemi. Mutace však nevznikají zcela náhodně se stejnou pravděpodobností, naopak, jejich výskyt je ovlivněn tzv. mutačními biasy, tedy různými tendencemi mutačních mechanismů, například obecnou preferencí tranzic před transverzemi nebo substitucemi na AT před GC. Současné studie demonstrují, že tyto nerovnoměrnosti nejsou přirozeným výběrem potlačeny, ale ovlivňují směr adaptivní evoluce. Články shrnuté v této bakalářské práci ukazují, že se z mutačního spektra dá vyvodit spektrum adaptivních substitucí, a dokonce i naopak. Mnoho mutačních biasů však zatím není objeveno či prozkoumáno. V této práci jsme si položily otázku, zda samotná struktura genetického kódu nezavádí další mutační tendenci, která ovlivňuje poměr adaptivních substitucí. Předpokládaly jsme, že změny dosažitelné větším počtem jedno-nukleotidových substitucí se budou mezi adaptivními mutacemi vyskytovat častěji. Tento předpoklad jsme testovaly pomocí korelační analýzy a negativně binomického modelu na datasetu substitucí vedoucích k...cs_CZ
uk.abstract.enTitle: The Influence of Mutation Bias on Adaptive Evolution Author: Barbora Jasková Department: Department of Cell Biology Supervisor: Dr. Hana Rozhoňová Abstract: In evolutionary biology, natural selection acts upon genetic variation, which arises through mutations. However, mutations do not happen with equal probability, their occurrence is shaped by mutation biases; for example, a general tendency to favour transitions over transversions, or to prefer substitutions towards AT rather than GC. Recent studies clearly document that such biases are not overridden by natural selection but can influence the direction of adaptive evolution. Studies explored in this thesis have shown that the spectrum of adaptive substitutions can be predicted from the mutation spectrum, and even vice versa. Many underlying biases however remain unknown or unexplored. In this thesis, we investigate whether the structure of the genetic code introduces a mutation bias that influences the frequency of adaptive substitutions. We hypothesised that changes accessible through a greater number of single-nucleotide substitutions would occur more frequently among adaptive mutations. To test this, we applied correlation analyses and a negative binomial model to a dataset of antibiotics resistance-conferring substitutions in Mycobacterium...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2025 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV