Do plant intermediate filaments exist?

Abstract

Intermediální filamenta patří mezi cytoskeletální proteiny. Vyskytují pouze u zástupců Metazoa, i když nedávno byly nalezeny homology v superskupině SAR a Amoebozoa. U rostlin se vyskytují analogy intermediálních filament, nuclear matrix constituent proitens (NMCPs). Jedná se o struk- turní analogy živočišných laminů. Mimo to se literatuře vyskytují anotace rostliných intermediál- ních filament, a daných anotací v současné době stále přibývá. Cílem práce bylo setřídit takto an- otované proteiny a rozhodnout, zda jejich název (intermediální filamentum) označuje skutečnost. Výsledky naznačují, že rostliny nemají pravé homology intermediálních filament, nicméně pro potvrzení bude třeba dalšího výzkumu.

Intermediate filaments are one of the 4 categories of cytoskeletal proteins. They are restricted to Metazoa, though recently new homologues are found in SAR supergroup and Amoebozoa. In plants, intermediate filaments analogues exist, they are structural components of the plant lam- ina. These are nuclear matrix constituent proteins (NMCPs). However, other plant intermediate filaments have been recently annotated in literature. Aim of this thesis is to sort out these annota- tions and declare, whether the use of term "intermediate filament" is justified. The results suggest, that no true intermediate filament homologues occur in plants. To clarify these findings, further research is needed.