Hodnocení záchytu abnormálních genetických variant metodami cytogenomiky u jedinců s poruchami autistického spektra

Abstract

Poruchy autistického spektra jsou velmi komplexní a heterogenní skupinou obtíží ovlivňující fyzický a psychický stav jedince na mnoha různých úrovních. Nezanedbatelná je rovněž prevalence autismu, která je odhadována na 0,5-3,5 % populace. Na etiologii poruch autistického spektra se podílí nejen faktory prostředí, ale také genetické faktory. Významný podíl těchto genetických aspektů tvoří varianty v počtu kopií. V závislosti na jejich lokaci v genomu a zasažení konkrétních genů mohou mít tyto varianty různé klinické důsledky. U osob s poruchami autistického spektra jsou některé z abnormálních variant pozorovány signifikantně častěji. Hlavní náplní této diplomové práce je pomocí vybraných cytogenomických metod (karyotypování, fluorescenční in-situ hybridizace a array komparativní genomové hybridizace) detekovat abnormální varianty v genomu jedinců s poruchou autistického spektra a následně tyto nálezy zhodnotit dle klinického dopadu. Práce obsahuje podrobný výčet, hodnocení a analýzu abnormálních variant nalezených u souboru jedinců s autismem či dalšími neurovývojovými obtížemi. Věnuje se zasaženým chromozomovým lokusům a funkcím jednotlivých genů. Práce se rovněž zabývá charakterizací zkoumaného souboru pacientů s ohledem na prevalenci autismu mezi pohlavími či zátěží jedinců a celých rodin...

Autism spectrum disorders are a complex and heterogeneous group of difficulties affecting the physical and psychological state of an individual on many different levels. The prevalence of autism is also notable, estimated at 0.5-3.5 % of the population. Not only environmental factors but also genetic factors are involved in the etiology of autism spectrum disorders. Large proportion of these genetic aspects is represented by copy number variants. Depending on their location in the genome and the specific genes affected, these variants can have different clinical consequences. Some of these abnormal variants are observed significantly more often in individuals with autism spectrum disorders. The main focus of this diploma thesis is to use selected cytogenomic methods (karyotyping, fluorescent in-situ hybridization and array comparative genomic hybridization) to detect abnormal variants in the genome of individuals with autism spectrum disorder and then to evaluate these findings according to clinical impact. The paper includes a detailed enumeration, evaluation and analysis of abnormal variants found in a cohort of individuals with autism or other neurodevelopmental difficulties. It focuses on the affected chromosomal loci and the function of individual genes. The paper also summarizes the...