Úloha ARE5 ABCF proteinů v antibiotické rezistenci a regulaci u rodu Streptomyces
The role of ARE5 ABCF proteins in antibiotic resistance and regulation in the genus Streptomyces
dizertační práce (OBHÁJENO)

Zobrazit/otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/197887Identifikátory
SIS: 170628
Kolekce
- Kvalifikační práce [20357]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Bobek, Jan
Pospíšil, Jiří
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Mikrobiologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
28. 3. 2025
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Prospěl/a
Klíčová slova (česky)
ARE ABCF proteiny, LmrC, TiaA, Streptomyces lincolnensis, Streptomyces coelicolor, LSAP antibiotická rezistence, linkomycinový BGC, mikrobiální interakce, regulace BGCKlíčová slova (anglicky)
ARE ABCF proteins, LmrC, TiaA, Streptomyces lincolnensis, Streptomyces coelicolor, LSAP antibiotic resistance, BGC of lincomycin, microbial interactions, regulation of BGCMikroorganismy se potřebují rychle adaptovat na změny prostředí, což vede k optimalizaci jejich genové exprese a jejímu vyústění v různé fenotypické projevy. Dynamika a komplexnost této plasticity není za současného stavu poznání stále plně pochopena. Tato práce se zaměřuje na rezistenční proteiny ARE5 podrodiny ABCF proteinů, které udílejí rezistenci vůči antibiotikům inhibujícím translaci vazbou na velkou 50S ribozomální podjednotku, konkrétně vůči linkosamidům, streptograminům A a pleuromutilinům (LSAP). U producenta linkomycinu Streptomyces lincolnensis ATCC 25466 se nám podařilo popsat zapojení ARE5 proteinu LmrC do nově objevené signální kaskády. Tato kaskáda urychluje nástup produkce linkomycinu v odpovědi na přítomnost antibiotik v prostředí, čímž dochází k synchronizaci produkce linkomycinu v bakteriální populaci. Protein LmrC spouští expresi pozitivního regulátoru LmbU, ten dále spouští vlastní produkci linkomycinu. Následně je produkce LmrC potlačena funkcí zbylých dvou rezistenčních proteinů LmrA a LmrB, jejichž geny jsou kódovány v linkomycinovém biosyntetickém genovém klastru (BGC) spolu s geny lmrC a lmbU. Vliv na produkci sekundárních metabolitů byl pozorován také pro ARE5 proteiny TiaA (SCO0636) a SCO6720 kódované v genomu bakterie Streptomyces coelicolor M145. Tyto proteiny...
Microorganisms need to quickly adapt to environmental changes, which leads to optimization of their gene expression and its manifestation in various phenotypic traits. The dynamics and complexity of this plasticity are not yet fully understood given the current state of knowledge. This work focuses on ARE5 resistance proteins of the ABCF protein subfamily, which provide resistance to antibiotics that inhibit translation by binding to the large 50S ribosomal subunit, specifically to lincosamides, streptogramins A, and pleuromutilins (LSAP). In the lincomycin producer Streptomyces lincolnensis ATCC 25466, we described the involvement of the ARE5 protein LmrC in a newly described signalling cascade. This cascade accelerates the onset of lincomycin production in response to the presence of antibiotics in the environment, leading to synchronization of lincomycin production in the bacterial population. The LmrC protein triggers the expression of the positive regulator LmbU, which further triggers lincomycin production itself. Subsequently, LmrC production is suppressed by the function of the remaining two resistance proteins LmrA and LmrB, whose genes are encoded in the lincomycin biosynthetic gene cluster (BGC) together with the lmrC and lmbU genes. The influence on secondary metabolite production was...
Citace dokumentu
Metadata
Zobrazit celý záznamSouvisející záznamy
Zobrazují se záznamy příbuzné na základě názvu, autora a předmětu.
-
Analýza genového shluku kódujícího biosyntézu manumycinového antibiotika U-62162 a způsoby jeho modifikace
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOUrbanová, Daniela (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2014)Datum obhajoby: 15. 9. 2014Bakterie rodu Streptomyces jsou největšími producenty antibiotik mezi mikroorganizmy. Malou skupinou těchto látek jsou manumycinová antibiotika. Jejich antibiotické účinky nejsou příliš významné, zato vykazují biologické ... -
The effect of 6S-like RNAs on physiological differentiation of Streptomyces coelicolor
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOBurýšková, Barbora (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2018)Datum obhajoby: 14. 2. 2018Rozmanitost bakterií a jejich genomů může zapříčinit konzervaci funkčních molekulárních motivů na úrovni strukturní místo konzervace na úrovni sekvencí. V případě regulační 6S RNA byly nalezeny sekvenční homology u více ... -
Kolonizácia ľudských pľúc nepatogénnymi streptomycétami
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOHerbrík, Andrej (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2019)Datum obhajoby: 3. 9. 2019Streptomycetes, primary soil saprophytic microorganisms are at the center of interest in many research groups, mainly because of their ability to produce a wide range of biologically active substances useful in medicine, ...