Beyond dogmas in biology: revisiting calmodulin, galectin-1 and fibroblast growth factor II binding to membranes

Scollo, Federica

Za hranice dogmat v biologii: přehodnocení vazby kalmodulinu, galektinu-1 a fibroblastového růstového faktoru II na membrány

dc.contributor.advisor	Hof, Martin
dc.creator	Scollo, Federica
dc.date.accessioned	2025-04-02T11:47:24Z
dc.date.available	2025-04-02T11:47:24Z
dc.date.issued	2025
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/20.500.11956/197660
dc.description.abstract	Biologické membrány hrají klíčovou roli v buněčných procesech a slouží jako dynamické platformy pro regulaci aktivity a interakcí proteinů. Navzdory jejich ústřednímu postavení zůstávají některá dogmata o interakcích mezi proteiny a membránami neprozkoumaná nebo neúplně ověřená, což může vést k opomenutí kritických aspektů těchto biomolekulárních procesů. Tato práce se vrací k dlouholetým předpokladům o interakci tří proteinů, kalmodulinu (CaM), galektinu-1 (Gal-1) a fibroblastového růstového faktoru 2 (FGF2), s lipidovými membránami a kriticky je zkoumá pomocí interdisciplinárního biofyzikálního přístupu kombinujícího výpočetní a experimentální techniky. Byly použity fluorescenční techniky a metody bez značení, včetně fluorescenční mikroskopie, Försterova rezonančního přenosu energie (FRET), fluorescenční korelační spektroskopie (FCS), fluorescenčně aktivovaného třídění buněk (FACS), generalizované polarizace Laurdanu (GP), izotermické titrační kalorimetrie (ITC), křemenné krystalové mikrováhy s monitorováním disipace (QCM-D), povrchové plazmonové rezonance (SPR), dynamického rozptylu světla (DLS) a zeta potenciálu. Práce se zabývala třemi zásadními otázkami a mezi hlavní zjištění patří: 1. CaM může interagovat přímo s membránou: Bylo zjištěno, že na rozdíl od své stanovené role molekuly...	cs_CZ
dc.language	English	cs_CZ
dc.language.iso	en_US
dc.publisher	Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta	cs_CZ
dc.subject	calmodulin	en_US
dc.subject	galectin-1	en_US
dc.subject	fibroblast growth factor	en_US
dc.subject	lipids	en_US
dc.subject	lipid bilayer	en_US
dc.subject	model membranes	en_US
dc.subject	spectroscopy	en_US
dc.subject	microscopy	en_US
dc.subject	fluorescence	en_US
dc.subject	label-free techniques	en_US
dc.subject	confocal microscopy	en_US
dc.subject	FRET	en_US
dc.subject	FACS	en_US
dc.subject	GP of Laurdan	en_US
dc.subject	DLS	en_US
dc.subject	Zeta potential	en_US
dc.subject	QCM-D	en_US
dc.subject	SPR	en_US
dc.subject	ITC	en_US
dc.subject	FCS	en_US
dc.subject	phosphatidylethanolamine	en_US
dc.subject	phosphatidylserine	en_US
dc.subject	calcium	en_US
dc.subject	gangliosides	en_US
dc.subject	GM1	en_US
dc.subject	GD1a	en_US
dc.subject	cross-linking	en_US
dc.subject	cholesterol	en_US
dc.title	Beyond dogmas in biology: revisiting calmodulin, galectin-1 and fibroblast growth factor II binding to membranes	en_US
dc.type	dizertační práce	cs_CZ
dcterms.created	2025
dcterms.dateAccepted	2025-03-12
dc.description.department	Katedra fyzikální a makromol. chemie	cs_CZ
dc.description.department	Department of Physical and Macromolecular Chemistry	en_US
dc.description.faculty	Faculty of Science	en_US
dc.description.faculty	Přírodovědecká fakulta	cs_CZ
dc.identifier.repId	213308
dc.title.translated	Za hranice dogmat v biologii: přehodnocení vazby kalmodulinu, galektinu-1 a fibroblastového růstového faktoru II na membrány	cs_CZ
dc.contributor.referee	Heberle, Joachim
dc.contributor.referee	Radenovic, Aleksandra
thesis.degree.name	Ph.D.
thesis.degree.level	doktorské	cs_CZ
thesis.degree.discipline	Physical Chemistry	en_US
thesis.degree.discipline	Fyzikální chemie	cs_CZ
thesis.degree.program	Physical Chemistry	en_US
thesis.degree.program	Physical Chemistry	cs_CZ
uk.thesis.type	dizertační práce	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-cs	Přírodovědecká fakulta::Katedra fyzikální a makromol. chemie	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-en	Faculty of Science::Department of Physical and Macromolecular Chemistry	en_US
uk.faculty-name.cs	Přírodovědecká fakulta	cs_CZ
uk.faculty-name.en	Faculty of Science	en_US
uk.faculty-abbr.cs	PřF	cs_CZ
uk.degree-discipline.cs	Fyzikální chemie	cs_CZ
uk.degree-discipline.en	Physical Chemistry	en_US
uk.degree-program.cs	Physical Chemistry	cs_CZ
uk.degree-program.en	Physical Chemistry	en_US
thesis.grade.cs	Prospěl/a	cs_CZ
thesis.grade.en	Pass	en_US
uk.abstract.cs	Biologické membrány hrají klíčovou roli v buněčných procesech a slouží jako dynamické platformy pro regulaci aktivity a interakcí proteinů. Navzdory jejich ústřednímu postavení zůstávají některá dogmata o interakcích mezi proteiny a membránami neprozkoumaná nebo neúplně ověřená, což může vést k opomenutí kritických aspektů těchto biomolekulárních procesů. Tato práce se vrací k dlouholetým předpokladům o interakci tří proteinů, kalmodulinu (CaM), galektinu-1 (Gal-1) a fibroblastového růstového faktoru 2 (FGF2), s lipidovými membránami a kriticky je zkoumá pomocí interdisciplinárního biofyzikálního přístupu kombinujícího výpočetní a experimentální techniky. Byly použity fluorescenční techniky a metody bez značení, včetně fluorescenční mikroskopie, Försterova rezonančního přenosu energie (FRET), fluorescenční korelační spektroskopie (FCS), fluorescenčně aktivovaného třídění buněk (FACS), generalizované polarizace Laurdanu (GP), izotermické titrační kalorimetrie (ITC), křemenné krystalové mikrováhy s monitorováním disipace (QCM-D), povrchové plazmonové rezonance (SPR), dynamického rozptylu světla (DLS) a zeta potenciálu. Práce se zabývala třemi zásadními otázkami a mezi hlavní zjištění patří: 1. CaM může interagovat přímo s membránou: Bylo zjištěno, že na rozdíl od své stanovené role molekuly...	cs_CZ
uk.file-availability	V
uk.grantor	Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyzikální a makromol. chemie	cs_CZ
thesis.grade.code	P
dc.contributor.consultant	Šachl, Radek
uk.publication-place	Praha	cs_CZ
uk.thesis.defenceStatus	O