Unraveling Nanoscale Membrane Organization of Gangliosides
Odhalování nanorozměrové membránové organizace gangliosidů
dissertation thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/197659Identifiers
Study Information System: 213006
Collections
- Kvalifikační práce [20350]
Author
Advisor
Consultant
Hof, Martin
Referee
Johansson, Lennart B.-Å.
Štěpánek, Miroslav
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Physical Chemistry
Department
Department of Physical and Macromolecular Chemistry
Date of defense
12. 3. 2025
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Pass
Keywords (Czech)
proteiny, lipidy, plazmatická membrána, lipidová dvojvrstva, spektroskopie, mikroskopie, fluorescence, detekce jednotlivých molekul, FRETKeywords (English)
proteins, lipids, plasma membrane, lipid bilayer, spectroscopy, microscopy, fluorescence, detection of single molecules, FRETTato disertační práce se zaměřuje na to, jak změny v glykanové hlavové skupině gangliosidů ovlivňují jejich schopnost vytvářet nanoskopické domény v syntetických lipidových membránách. Gangliosidy jsou klíčovými složkami membránových heterogenit, často označovaných jako lipidové rafty, a jejich interakce s ostatními druhy lipidů jsou klíčové pro buněčné procesy. Ke studiu těchto mechanismů se v této práci používá MC-FRET (Försterův rezonanční přenos energie analyzovaný pomocí simulací Monte Carlo), fluorescenční technika navržená tak, aby překonala limity rozlišení tradiční mikroskopie. MC-FRET umožňuje detekci nanodomén o velikosti pouhých několika nanometrů a poskytuje přesná měření jejich velikosti a povrchové hustoty. Zásadní je, že nabízí také rozlišení napříč vrstvami, což umožňuje rozlišit mezi nanodoménami spřaženými mezi jednotlivými leafletami membrány a těmi, které jsou nezávislé nebo proti sobě registrované. Tato schopnost řeší kritickou mezeru v tradičních zobrazovacích technikách, které nedokážou rozlišit tloušťku lipidových dvojvrstev v nanoměřítku. Výsledky ukazují, že jemné strukturní rozdíly v glykanové hlavové skupině a počet a uspořádání zbytků kyseliny sialové významně ovlivňují shlukování gangliosidů a stabilitu nanodomén. Tyto strukturní rozdíly ovlivňují jak laterální interakce s...