Bioarcheologie a tuberkulóza v populacích minulosti - evoluce, ekologie a diagnostika mykobakteriální infekce pomocí metod molekulární biologie

Abstract

Tuberkulóza patří mezi nejstarší známé infekční choroby, které provázely lidské populace napříč historií. Tato bakalářská práce se zaměřuje na studium tuberkulózy v historických populacích prostřednictvím kombinace bioarcheologických a molekulárně-biologických přístupů. Hlavním cílem je analyzovat projevy tuberkulózy v kosterních pozůstatcích a hodnotit přínos moderních diagnostických metod, jako jsou PCR, NGS, lipidické biomarkery a paleoproteomika, při detekci Mycobacterium tuberculosis komplex. Práce se zabývá výhodami a limity jednotlivých metod, přičemž zvláštní pozornost věnuje problematice degradace DNA a kontaminace vzorků. Výsledky této práce zdůrazňují důležitost integrace tradičních paleopatologických postupů a moderních technologií pro hlubší pochopení evoluce a šíření tuberkulózy v minulosti. Klíčová slova Tuberkulóza, Mycobacterium tuberculosis, bioarcheologie, molekulárně-biologické metody, PCR, NGS, paleoproteomika, lipidické biomarkery, evoluce tuberkulózy

Tuberculosis is one of humanity's oldest infectious diseases that has significantly impacted populations throughout history. This bachelor thesis focuses on the study of tuberculosis in historical populations using an interdisciplinary approach that combines bioarchaeological analysis with molecular biological methods. The main objective is to analyse the manifestations of tuberculosis in skeletal remains and to assess the effectiveness of modern diagnostic tools, including PCR, NGS, lipid biomarkers, and paleoproteomics, in detecting the Mycobacterium tuberculosis complex. The paper discusses the benefits and limitations of each method, with a particular focus on challenges related to DNA degradation and sample contamination The findings underscore the value of integrating traditional palaeopathological techniques with advanced molecular approaches to achieve a more comprehensive understanding of the evolution, spread, and historical impact of tuberculosis. Keywords Tuberculosis, Mycobacterium tuberculosis, bioarchaeology, molecular biology methods, PCR, NGS, palaeoproteomics, lipid biomarkers, evolution of tuberculosis