Zobrazit minimální záznam

Comparison of quantum chemical methods for description of noncovalent interactions
dc.contributor.advisorHobza, Pavel
dc.creatorGráfová, Lucie
dc.date.accessioned2025-02-08T10:03:59Z
dc.date.available2025-02-08T10:03:59Z
dc.date.issued2009
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/196471
dc.description.abstractIn this work, an extension of the S22 data set of Jurecka et al. (Jurečka, P.; Šponer, J.; Černý, J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 1985.), the data set of benchmark CCSD(T)/CBS interaction energies of twenty-two noncovalent complexes in equilibrium geometries, is presented. The S22 data set has been extended by including the stretched (one shortened and three elongated) complex geometries of the S22 data set along the main noncovalent interaction coordinate. The goal of this work is to assess the accuracy of the popular wave function methods (MP2-, MP3- and, CCSD- based) and density functional methods (with and without empirical correction for the dispersion energy) for noncovalent complexes based on a statistical evaluation not only in equilibrium, but also in nonequilibrium geometries. The results obtained in this work provide information on whether an accurate and balanced description of the different interaction types and complex geometry distortions can be expected from the tested methods. This information has an important implication in the calculation of large molecular complexes, where the number of distant interacting molecular fragments, often in far from equilibrium geometries, increases rapidly with the system size. The best performing WFT methods were found to be the...en_US
dc.description.abstractV práci je představeno rozšíření setu S22. Původní set S22 obsahoval CCSD(T)/CBS interakční energie dvaceti dvou nekovalentních komplexů v rovnovážné geometrii (Jurečka, P.; Šponer, J.; Černý, J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 1985). Rozšířený set S22 zahrnuje kromě původních dat setu S22 také interakční energie nekovalentních komplexů S22 v nerovnovážných geometriích (geometrie byly vytvořeny zkrácením a prodloužením vazby podél hlavní interakční koordináty). Cílem práce je porovnat přesnost používaných wave function metod (metody založené na MP2, MP3 a CCSD) a density functional method (s i bez empirické korekce pro popis disperzní energie) pro popis nekovalentních komplexů (v rovnovážné i nerovnovážné geometrii) na základě statistického vyhodnocení. Výsledky práce poskytují informaci o přesnosti a vyrovnanosti popisu testovaných metod pro různé druhy interakcí a různé druhy geometrií komplexních sloučenin. Tyto informace jsou zásadní pro výpočet energie velkých molekulových komplexů, kde počet jednotlivých interakčních molekulových fragmentů, jejichž geometrie je mnohdy velmi vzdálená od rovnovážné, rychle stoupá s velikostí komplexů. Nejlepších výsledků z WFT metod dosáhli metody SCS-CCSD (spin-component škálovaná CCSD, Takatani, T.; Hohenstein, E. G.; Sherrill, C. D. J. Chem....cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleSrovnání kvantově chemických metod pro popis nekovalentních interakcícs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2009
dcterms.dateAccepted2009-09-24
dc.description.departmentKatedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId75570
dc.title.translatedComparison of quantum chemical methods for description of noncovalent interactionsen_US
dc.contributor.refereePitoňák, Michal
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineModelling of Chemical Properties of Nano- and Biostructuresen_US
thesis.degree.disciplineModelování chemických vlastností nano- a biostrukturcs_CZ
thesis.degree.programChemistryen_US
thesis.degree.programChemiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csModelování chemických vlastností nano- a biostrukturcs_CZ
uk.degree-discipline.enModelling of Chemical Properties of Nano- and Biostructuresen_US
uk.degree-program.csChemiecs_CZ
uk.degree-program.enChemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csV práci je představeno rozšíření setu S22. Původní set S22 obsahoval CCSD(T)/CBS interakční energie dvaceti dvou nekovalentních komplexů v rovnovážné geometrii (Jurečka, P.; Šponer, J.; Černý, J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 1985). Rozšířený set S22 zahrnuje kromě původních dat setu S22 také interakční energie nekovalentních komplexů S22 v nerovnovážných geometriích (geometrie byly vytvořeny zkrácením a prodloužením vazby podél hlavní interakční koordináty). Cílem práce je porovnat přesnost používaných wave function metod (metody založené na MP2, MP3 a CCSD) a density functional method (s i bez empirické korekce pro popis disperzní energie) pro popis nekovalentních komplexů (v rovnovážné i nerovnovážné geometrii) na základě statistického vyhodnocení. Výsledky práce poskytují informaci o přesnosti a vyrovnanosti popisu testovaných metod pro různé druhy interakcí a různé druhy geometrií komplexních sloučenin. Tyto informace jsou zásadní pro výpočet energie velkých molekulových komplexů, kde počet jednotlivých interakčních molekulových fragmentů, jejichž geometrie je mnohdy velmi vzdálená od rovnovážné, rychle stoupá s velikostí komplexů. Nejlepších výsledků z WFT metod dosáhli metody SCS-CCSD (spin-component škálovaná CCSD, Takatani, T.; Hohenstein, E. G.; Sherrill, C. D. J. Chem....cs_CZ
uk.abstract.enIn this work, an extension of the S22 data set of Jurecka et al. (Jurečka, P.; Šponer, J.; Černý, J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 1985.), the data set of benchmark CCSD(T)/CBS interaction energies of twenty-two noncovalent complexes in equilibrium geometries, is presented. The S22 data set has been extended by including the stretched (one shortened and three elongated) complex geometries of the S22 data set along the main noncovalent interaction coordinate. The goal of this work is to assess the accuracy of the popular wave function methods (MP2-, MP3- and, CCSD- based) and density functional methods (with and without empirical correction for the dispersion energy) for noncovalent complexes based on a statistical evaluation not only in equilibrium, but also in nonequilibrium geometries. The results obtained in this work provide information on whether an accurate and balanced description of the different interaction types and complex geometry distortions can be expected from the tested methods. This information has an important implication in the calculation of large molecular complexes, where the number of distant interacting molecular fragments, often in far from equilibrium geometries, increases rapidly with the system size. The best performing WFT methods were found to be the...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV