Dlouhodobý mírný stres v koloniích Saccharomyces cerevisiae s delecí WHI3

Krampotová, Ester

Long term sublethal stress in colonies of Saccharomyces cerevisiae deleted in WHI3

dc.contributor.advisor	Schierová, Michaela
dc.creator	Krampotová, Ester
dc.date.accessioned	2024-11-29T10:19:05Z
dc.date.available	2024-11-29T10:19:05Z
dc.date.issued	2024
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/20.500.11956/190019
dc.description.abstract	Druh Saccharomyces cerevisiae je vhodným modelem pro studium mnoha biologických procesů, včetně adaptace na stresové podmínky. V posledních 40 letech byla u S. cerevisiae popsána interak- ce mnoha signálních drah při odpovědi na akutní stres vyvolaný vysokou teplotou, osmotickým stresem nebo vysokou koncentrací kovů. Méně dostupných informací je o vlivu subletálních dávek stresoru. Výhodou kmene s delecí WHI3, který jsem v této práci použila, je schopnost reagovat na změnu ve složení média nejen snížením rychlosti růstu, ale i změnou morfologie kolonie. Protein Whi3 nejen stimuluje produkci flokulinu Flo11, ale i aktivitu obecných transkripčních faktorů Msn2 a Msn4. Cílem práce bylo zjistit, zda jsou změny exprese genů kódujících stresové proteiny vyvolané subletálními dávkami inhibitoru závislé na genotypu WHI3, YAP6 a MPT5. Transkripční faktor Yap6 i RNA vazebný protein Mpt5 jsou zapojeny do odpovědi na stres a mají negativní vliv na expresi FLO11. Jejich hladina je závislá na Whi3. K navození stresu jsem využívala nízké koncentrace NaCl a CdSO4, kterými jsem působila po dobu 4 a 6 dnů na kolonie, které se lišily genotypem v genech WHI3, YAP6 a MPT5. Z našich experimentů vyplývá, že i při mírném stresu dochází k aktivaci stresové odpovědi a ke změně morfologie kolonií. Zatímco u všech pěti...	cs_CZ
dc.description.abstract	The yeast species Saccharomyces cerevisiae is a suitable model for studying many biological processes, including adaptation to stress conditions. Over the past 40 years, multiple signaling pathways have been uncovered to play an important role in the response to acute stress induced by high temperature, osmotic stress, or high concentrations of metals in S. cerevisiae. The effect of sublethal dose of stressor is rather neglected. The advantage of the WHI3 deletion strain used in this work is its sensitivity to the presence of stressor in the solid medium not only by reducing the growth rate but also by changing the colony morphology. The Whi3 protein stimulates not only flocculin Flo11 production but also the activity of the general transcription factors Msn2 and Msn4. The diploma project aimed to determine whether changes in the expression of genes coding for stress proteins induced by sublethal doses of the stressor were dependent on the genotype WHI3, YAP6, and MPT5. Transcription factor Yap6 and RNA binding protein Mpt5 are both involved in stress response and cause repression of FLO11. Their levels depend on Whi3. To induce mild stress, low concentrations of NaCl and CdSO4 have been applied to colonies for 4 and 6 days. Their genotype varied in the WHI3, YAP6, and MPT5 genes. Our experiments...	en_US
dc.language	Čeština	cs_CZ
dc.language.iso	cs_CZ
dc.publisher	Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta	cs_CZ
dc.subject	yeast colony	en_US
dc.subject	structured morphology,stress conditions	en_US
dc.subject	gene expression	en_US
dc.subject	FLO11	en_US
dc.subject	WHI3	en_US
dc.subject	MPT5	en_US
dc.subject	YAP6	en_US
dc.subject	kvasinkové kolonie	cs_CZ
dc.subject	vrásčitá struktura	cs_CZ
dc.subject	stresové podmínky	cs_CZ
dc.subject	genová exprese	cs_CZ
dc.subject	FLO11	cs_CZ
dc.subject	WHI3	cs_CZ
dc.subject	MPT5	cs_CZ
dc.subject	YAP6	cs_CZ
dc.title	Dlouhodobý mírný stres v koloniích Saccharomyces cerevisiae s delecí WHI3	cs_CZ
dc.type	diplomová práce	cs_CZ
dcterms.created	2024
dcterms.dateAccepted	2024-05-28
dc.description.department	Department of Genetics and Microbiology	en_US
dc.description.department	Katedra genetiky a mikrobiologie	cs_CZ
dc.description.faculty	Přírodovědecká fakulta	cs_CZ
dc.description.faculty	Faculty of Science	en_US
dc.identifier.repId	268167
dc.title.translated	Long term sublethal stress in colonies of Saccharomyces cerevisiae deleted in WHI3	en_US
dc.contributor.referee	Dušková, Michala
thesis.degree.name	Mgr.
thesis.degree.level	navazující magisterské	cs_CZ
thesis.degree.discipline	Molecular Biology and Genetics of Eukaryotes	en_US
thesis.degree.discipline	Molekulární biologie a genetika eukaryot	cs_CZ
thesis.degree.program	Genetics, Molecular Biology and Virology	en_US
thesis.degree.program	Genetika, molekulární biologie a virologie	cs_CZ
uk.thesis.type	diplomová práce	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-cs	Přírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologie	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-en	Faculty of Science::Department of Genetics and Microbiology	en_US
uk.faculty-name.cs	Přírodovědecká fakulta	cs_CZ
uk.faculty-name.en	Faculty of Science	en_US
uk.faculty-abbr.cs	PřF	cs_CZ
uk.degree-discipline.cs	Molekulární biologie a genetika eukaryot	cs_CZ
uk.degree-discipline.en	Molecular Biology and Genetics of Eukaryotes	en_US
uk.degree-program.cs	Genetika, molekulární biologie a virologie	cs_CZ
uk.degree-program.en	Genetics, Molecular Biology and Virology	en_US
thesis.grade.cs	Velmi dobře	cs_CZ
thesis.grade.en	Very good	en_US
uk.abstract.cs	Druh Saccharomyces cerevisiae je vhodným modelem pro studium mnoha biologických procesů, včetně adaptace na stresové podmínky. V posledních 40 letech byla u S. cerevisiae popsána interak- ce mnoha signálních drah při odpovědi na akutní stres vyvolaný vysokou teplotou, osmotickým stresem nebo vysokou koncentrací kovů. Méně dostupných informací je o vlivu subletálních dávek stresoru. Výhodou kmene s delecí WHI3, který jsem v této práci použila, je schopnost reagovat na změnu ve složení média nejen snížením rychlosti růstu, ale i změnou morfologie kolonie. Protein Whi3 nejen stimuluje produkci flokulinu Flo11, ale i aktivitu obecných transkripčních faktorů Msn2 a Msn4. Cílem práce bylo zjistit, zda jsou změny exprese genů kódujících stresové proteiny vyvolané subletálními dávkami inhibitoru závislé na genotypu WHI3, YAP6 a MPT5. Transkripční faktor Yap6 i RNA vazebný protein Mpt5 jsou zapojeny do odpovědi na stres a mají negativní vliv na expresi FLO11. Jejich hladina je závislá na Whi3. K navození stresu jsem využívala nízké koncentrace NaCl a CdSO4, kterými jsem působila po dobu 4 a 6 dnů na kolonie, které se lišily genotypem v genech WHI3, YAP6 a MPT5. Z našich experimentů vyplývá, že i při mírném stresu dochází k aktivaci stresové odpovědi a ke změně morfologie kolonií. Zatímco u všech pěti...	cs_CZ
uk.abstract.en	The yeast species Saccharomyces cerevisiae is a suitable model for studying many biological processes, including adaptation to stress conditions. Over the past 40 years, multiple signaling pathways have been uncovered to play an important role in the response to acute stress induced by high temperature, osmotic stress, or high concentrations of metals in S. cerevisiae. The effect of sublethal dose of stressor is rather neglected. The advantage of the WHI3 deletion strain used in this work is its sensitivity to the presence of stressor in the solid medium not only by reducing the growth rate but also by changing the colony morphology. The Whi3 protein stimulates not only flocculin Flo11 production but also the activity of the general transcription factors Msn2 and Msn4. The diploma project aimed to determine whether changes in the expression of genes coding for stress proteins induced by sublethal doses of the stressor were dependent on the genotype WHI3, YAP6, and MPT5. Transcription factor Yap6 and RNA binding protein Mpt5 are both involved in stress response and cause repression of FLO11. Their levels depend on Whi3. To induce mild stress, low concentrations of NaCl and CdSO4 have been applied to colonies for 4 and 6 days. Their genotype varied in the WHI3, YAP6, and MPT5 genes. Our experiments...	en_US
uk.file-availability	N
uk.grantor	Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologie	cs_CZ
thesis.grade.code	2
dc.contributor.consultant	Vopálenská, Irena
uk.publication-place	Praha	cs_CZ
dc.date.embargoEndDate	29-05-2027
uk.embargo.reason	Protection of information protected by a special law	en
uk.embargo.reason	Ochrana informací chráněných zvláštním zákonem	cs
uk.thesis.defenceStatus	O