Zobrazit minimální záznam

Sledování permeabilizace membrány na jednotlivých lipidových vezikulech - vývoj metody.
dc.contributor.advisorŠachl, Radek
dc.creatorGücklhorn, David
dc.date.accessioned2022-10-17T13:12:13Z
dc.date.available2022-10-17T13:12:13Z
dc.date.issued2022
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/176447
dc.description.abstractProtein complexes are challenging systems to study, especially when these complexes form on lipid membranes only for a short period of time. This is also the case of fibroblast growth factor 2 (FGF2), a protein that has many physiological and pathological functions in the human organism. It plays major role in the development of cancer as it promotes cell survival and angiogenesis. It also serves as a basis for development of novel treatments of nerve injuries. Despite being heavily studied for many years, it remains unclear how the protein is translocated into the extracellular space where it performs its function. To study complex systems such as FGF2 that self-assembles on the membrane into membrane penetrating pores we decided to develop a simple and efficient fluorescent microscopy method. This method is called double leakage single GUV assay (DLSGA). It utilizes giant unilamellar vesicles (GUVs) mimicking native cellular membranes. In a single experiment, up to 300 individual GUVs are imaged for the content of a leakage dye that reports on the presence of FGF2 pores. During three measurements and under different conditions, detailed information about pore-opening dynamics is gained for each GUV. Results of these measurements are then used to divide GUVs into six groups based on formation and...en_US
dc.description.abstractProteinové komplexy se obtížně studují, obzvlášť pokud vznikají jen v membránovém prostředí a na velmi krátkou dobu. Toto je problematické například v případě fibroblastového růstového faktoru 2 (FGF2), což je protein s mnoha fyziologickými i patologickými funkcemi v lidském organismu. Hraje zásadní roli v rozvoji různých nádorových onemocnění, protože braní apoptóze buněk pomocí autokrinní signalizace a také stimuluje angiogenezi. Zároveň je v současné době zkoumána možnost jeho uplatnění v léčbě zranění periferního nervstva. Přestože je důkladně zkoumán již řadu let, mechanismus jeho translokace do mezibuněčného prostoru, kde vykonává svou funkci, nebyl zcela objasněn. Pro studium komplexních systému, jako jsou membránové póry tvořené FGF2, jsme vyvinuli jednoduchou a efektivní metodu fluorescenční mikroskopie. Tato metoda se jmenuje dvojitá permeabilizační esej jednotlivých vezikulů (DLSGA). Využívá lipidové vezikuly (GUVs) pro simulaci buněčné membrány. V jediném experimentu je možné sledovat až 300 jednotlivých vezikulů a tvorbu pórů v jejich membráně. Během třech měření za různých podmínek získáváme detailní informaci o dynamice otevírání pórů na každém vezikulu. Na základě těchto měření je možné jednotlivé vezikuly rozdělit do šesti skupin podle toho, jestli se na nich tvořili póry a jak...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectFGF2en_US
dc.subjectproteinsen_US
dc.subjectlipid membranesen_US
dc.subjectfluorescenceen_US
dc.subjectFRETen_US
dc.subjectfluorescence spectroscopyen_US
dc.subjectfluorescence microscopyen_US
dc.subjectspectroscopyen_US
dc.subjectbiophysicsen_US
dc.subjectbiophysical chemistryen_US
dc.subjectFGF2cs_CZ
dc.subjectproteinycs_CZ
dc.subjectlipidové membránycs_CZ
dc.subjectfluorescencecs_CZ
dc.subjectFRETcs_CZ
dc.subjectfluorescenční spektroskopiecs_CZ
dc.subjectmikroskopiecs_CZ
dc.subjectspektroskopiecs_CZ
dc.subjectbiofyzikacs_CZ
dc.subjectbiofyzikální chemiecs_CZ
dc.titleTracking membrane permeabilization on single lipid vesicles - method development.en_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2022
dcterms.dateAccepted2022-09-12
dc.description.departmentDepartment of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId199706
dc.title.translatedSledování permeabilizace membrány na jednotlivých lipidových vezikulech - vývoj metody.cs_CZ
dc.contributor.refereeHeřman, Petr
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiophysical Chemistryen_US
thesis.degree.disciplineBiofyzikální chemiecs_CZ
thesis.degree.programChemistryen_US
thesis.degree.programChemiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiofyzikální chemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiophysical Chemistryen_US
uk.degree-program.csChemiecs_CZ
uk.degree-program.enChemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csProteinové komplexy se obtížně studují, obzvlášť pokud vznikají jen v membránovém prostředí a na velmi krátkou dobu. Toto je problematické například v případě fibroblastového růstového faktoru 2 (FGF2), což je protein s mnoha fyziologickými i patologickými funkcemi v lidském organismu. Hraje zásadní roli v rozvoji různých nádorových onemocnění, protože braní apoptóze buněk pomocí autokrinní signalizace a také stimuluje angiogenezi. Zároveň je v současné době zkoumána možnost jeho uplatnění v léčbě zranění periferního nervstva. Přestože je důkladně zkoumán již řadu let, mechanismus jeho translokace do mezibuněčného prostoru, kde vykonává svou funkci, nebyl zcela objasněn. Pro studium komplexních systému, jako jsou membránové póry tvořené FGF2, jsme vyvinuli jednoduchou a efektivní metodu fluorescenční mikroskopie. Tato metoda se jmenuje dvojitá permeabilizační esej jednotlivých vezikulů (DLSGA). Využívá lipidové vezikuly (GUVs) pro simulaci buněčné membrány. V jediném experimentu je možné sledovat až 300 jednotlivých vezikulů a tvorbu pórů v jejich membráně. Během třech měření za různých podmínek získáváme detailní informaci o dynamice otevírání pórů na každém vezikulu. Na základě těchto měření je možné jednotlivé vezikuly rozdělit do šesti skupin podle toho, jestli se na nich tvořili póry a jak...cs_CZ
uk.abstract.enProtein complexes are challenging systems to study, especially when these complexes form on lipid membranes only for a short period of time. This is also the case of fibroblast growth factor 2 (FGF2), a protein that has many physiological and pathological functions in the human organism. It plays major role in the development of cancer as it promotes cell survival and angiogenesis. It also serves as a basis for development of novel treatments of nerve injuries. Despite being heavily studied for many years, it remains unclear how the protein is translocated into the extracellular space where it performs its function. To study complex systems such as FGF2 that self-assembles on the membrane into membrane penetrating pores we decided to develop a simple and efficient fluorescent microscopy method. This method is called double leakage single GUV assay (DLSGA). It utilizes giant unilamellar vesicles (GUVs) mimicking native cellular membranes. In a single experiment, up to 300 individual GUVs are imaged for the content of a leakage dye that reports on the presence of FGF2 pores. During three measurements and under different conditions, detailed information about pore-opening dynamics is gained for each GUV. Results of these measurements are then used to divide GUVs into six groups based on formation and...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV