Syntéza konjugátů oligonukleotidů s molekulami zvyšujícími pevnost vazby na řetězce nukleových kyselin

Abstract

Distamycin A, netropsin, Hoechst 33258 a další jsou látky, které se váží do malého žlábku dvoušroubovice DNA na sekvence bohaté na A·T páry bází. Tato diplomová práce se zabývá syntézou látek strukturně odvozených od modelové molekuly distamycinu A a jejich konjugací s oligonukleotidy. Syntéza látek odvozených od distamycinu A byla prováděna metodami peptidové syntézy v roztoku a na pevné fázi. K připravení požadovaných látek bylo provedeno množství dílčích reakcí, které byly úspěšné pouze částečně. Nejperspektivnější se zdá být námi připravená molekula tert-butyl-5-(5-(2-(2-(2-(2- azidoethoxy)ethoxy)ethoxy)ethylkarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrol-3-ylkarbamoyl)-1-methyl- 1H-pyrol-3-yl-karbamátu.

Distamycin A, netropsin, Hoechst 33258 and other are substances that bind in minor groove in the double helix of A·T base pairs DNA sequences. This diploma thesis describes the synthesis of compounds structurally derived from the model molecule distamycin A and their conjugation with oligonucleotides. Synthesis of compounds derived from distamycin A was performed by methods of peptide synthesis in solution and on solid phase. For preparation of desired compounds have been carried out a number of sectional reactions which were only partially successful. The most promising seems to be molecule tert-butyl-5- (5-(2-(2-(2-(2-azidoethoxy)ethoxy)ethoxy)ethylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrole-3- ylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrole-3-yl-carbamate.