Interakce transkripčního a translačního aparátu u bakterie Bacillus subtilis
Interactions of the transcription and translation machineries in Bacillus subtilis
diploma thesis (DEFENDED)
Item with restricted access
Whole item or its parts have restricted access until 27. 05. 2028
Reason for restricted acccess:
Protection of intellectual property, particularly protection of inventions or technical solutions
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/199331Identifiers
Study Information System: 263942
Collections
- Kvalifikační práce [20864]
Author
Advisor
Referee
Ulrych, Aleš
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular Biology and Genetics of Prokaryotic and Eukaryotic Microorganisms
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
28. 5. 2025
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
RNA polymeráza, translační elongační faktory, transkripce, interakceKeywords (English)
RNA polymerase, translation elongation factors, transcription, interactionTranskripce a translace jsou základní procesy genové exprese v bakteriálních buňkách. Ačkoliv jsou tyto procesy funkčně odlišné, tak probíhají ve vzájemné souhře, což zajišťuje efektivní expresi genů a rychlou adaptaci na změny v prostředí. RNA polymeráza (RNAP) v transkripci a ribozom v translaci představují klíčové komponenty, které umožňují koordinovanou integraci těchto dvou procesů. Bakterie nemají jadernou membránu a v řadě druhů jsou tyto procesy fyzicky propojeny. Tento jev, nazývaný transkripčně-translační spojení, hraje zásadní regulační roli a přispívá k efektivnímu zpracování genetické informace, což umožňuje bakteriím rychle reagovat na vnější podněty a přizpůsobovat se měnícím se podmínkám. Tato koordinace mezi transkripcí a translací však není přítomna u všech bakterií. Bacillus subtilis je příkladem bakterie, kde je RNAP rychlejší než ribozom a k této interakci nedochází. Tato diplomová práce je zaměřena na komunikaci mezi transkripcí a translací u Bacillus subtilis. V mé laboratoři byla identifikována interakce RNAP s translačním elongačním faktorem Tu (EF-Tu). To představuje doposud málo prozkoumané propojení, které může koordinovat transkripci s translací u bakterií. V této práci jsem charakterizovala interakci mezi RNAP a EF-Tu a definovala její vliv na transkripci. Tato...
Transcription and translation are fundamental processes of gene expression in bacterial cells. Although these processes are functionally distinct, they occur in close coordination, ensuring efficient gene expression and rapid adaptation to environmental changes. RNA polymerase (RNAP) in transcription and the ribosome in translation are key components that enable the integrated coordination of these two processes. Bacteria lack a nuclear membrane, and in many species these processes are physically coupled. This phenomenon, known as transcription-translation coupling, plays a crucial regulatory role and contributes to the efficient processing of genetic information, allowing bacteria to quickly respond to external stimuli and adapt to changing conditions. However, this coordination between transcription and translation is not present in all bacteria. Bacillus subtilis is an example of a bacterium in which RNAP is faster than the ribosome, and this interaction does not occur. This thesis focuses on the communication between transcription and translation in Bacillus subtilis. In my laboratory, an interaction between RNAP and a translational elongation factor Tu (EF-Tu) was identified. This represents a poorly understood link between transcription and translation in bacteria, which may coordinate these...