Detekce přestaveb genů pro imunoreceptory u akutní lymfoblastické leukémie a u zdravých krevních buněk

Abstract

Lidský imunitní systém se setkává s miliony nejrůznějšíc h antigenll a antigenních epitopu. Sch pnost ly mfocy tů specificky reagovat na tylO podnět y je zaj ištěn a obrovskou rozmanitostí anti genn ě-specifických receptorů - imuno g lo bulinů (lg) Ll B lymfocy tll a I-b uně č n ých re c eptorů (TeR) u T lymfocytů. Kdyby byl celý tento repertoár kódován o ddělenými geny, zabral by většinu genomu. Namísto toho vznikl v průbě h u evoluce systém, který pomocí přeskupování omezeného množství genových segmentu dokáže vy tvořit kombinace, které jsou jedinečné pro každý lymfocyt nebo lymfocytárn í klon. Povrchové i sekretované imunoglobuliny B I ymfocytů se skládaj í ze dvou těžkých (lgH) a dvou lehk ' ch (TgL) řetězců , spoj ených disulfidovou vazbou. Geny kódující 19B řet ězce se nacházej í v genovém komplexu na chromosomu 14q32.3 v oblasti pokrývaj ící asi 1250 kb. ento komplex obsahuje v závislosti na haplotypuna 5 ' konci skupinu 46-52 fu nkčních sekvenčně podobných úsekl'l V ("variabil ita"), rozděle ných na základě homologie do 6-7 rodin. Dále následuje skupina 27 úseků D ("diversita"), pak skupina 6 laátkých úseků J ("joining") a na 3' konci jsou uspořádány genové segmenty konstantní část i těžkého řetězcc ce), jejichž použitím jsou definovány jednotlivé třídy imunoglobulinů. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)

The human immune system encounters millions of diverse antigens and antigenic epitopes. The ability of lymphocytes to respond specifically to these stimuli is ensured by the immense diversity of antigen-specific receptors-immunoglobulins (Ig) on B lymphocytes and T-cell receptors (TCRs) on T lymphocytes. If the entire repertoire of these receptors were encoded by separate genes, it would occupy the majority of the genome. Instead, evolution has produced a system that, through the recombination of a limited number of gene segments, can generate unique combinations for each lymphocyte or lymphocyte clone. Both membrane-bound and secreted immunoglobulins of B lymphocytes are composed of two heavy (IgH) and two light (IgL) chains, linked by disulfide bonds. The genes encoding the IgH chains are located in a gene complex on chromosome 14q32.3, covering approximately 1250 kilobases. Depending on the haplotype, this complex contains at its 5' end a group of 46-52 functionally and sequentially similar V ("variable") segments, divided into 6-7 families based on sequence homology. These are followed by a group of 27 D ("diversity") segments and a group of 6 J ("joining") segments. At the 3' end are the constant (C) gene segments of the heavy chain, whose usage defines the individual classes of immunoglobulins.