Remodelling of Extracellular Matrix in Microenvironment of High Grade Gliomas and Brain Metastases

Výmola, Petr

Remodelace extracelulární matrix v mikroprostředí gliomů o vysokém stupni malignity a mozkových metastáz

dc.contributor.advisor	Šedo, Aleksi
dc.creator	Výmola, Petr
dc.date.accessioned	2025-02-13T09:55:25Z
dc.date.available	2025-02-13T09:55:25Z
dc.date.issued	2025
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/20.500.11956/196639
dc.description.abstract	Progrese mozkových nádorů způsobuje významné změny ve složení extracelulární matrix (ECM) mozku. Jednou z těchto změn je zvýšená exprese fibrilárních proteinů ECM. Proteiny jako kolagen I a fibronektin významně ovlivňují progresi mozkových nádorů a jejich exprese koreluje s horším stavem pacientů. Přesná role a buněčný původ těchto proteinů však stále zůstává neodhalena. V této disertační práci jsme se zaměřili na expresi a roli fibrilárních proteinů extracelulární matrix, jako je kolagen I a fibronektin, v mikroprostředí nejčastějších nádorů mozku, glioblastomu a mozkových metastáz. V případě glioblastomu jsme detekovali zvýšené hladiny těchto fibrilárních proteinů v oblastech s vyšší expresí fibroblastového aktivačního proteinu (FAP), který se v glioblastomu nachází především na buňkách podobných pericytům. FAP+ pericytům podobné buňky byly v bioptických vzorcích detekovány v oblastech bohatých na kolagen I a fibronektin a produkovaly podstatně více kolagenu I a fibronektinu in vitro ve srovnání s ostatními buňkami v mikroprostředí glioblastomu. Pomocí hmotnostní spektrometrie jsme potvrdili, že 3D extracelulární matrix vytvořené FAP+ pericytům podobnými buňkami jsou bohaté na kolagen I, fibronektin a další esenciální proteiny bazální membrány a vykazují odlišný expresní profil ve srovnání s...	cs_CZ
dc.description.abstract	The progression of brain tumors leads to substantial alterations in both the quantity and composition of extracellular matrix (ECM). One of the changes includes higher expression of fibrillar ECM proteins, such as collagen I and fibronectin, which strongly affect the progression of brain tumors and correlate with poor patient outcome. However, the cellular origin and exact role of fibrillar ECM proteins in brain tumors remains unclear. In this doctoral thesis, we aimed our work on the expression and role of collagen I and fibronectin in the microenvironment of the most common brain tumors, glioblastoma and brain metastases. In glioblastoma we identified that elevated levels of these fibrillar proteins were associated with the expression of fibroblast activation protein (FAP), mainly found in pericyte-like cells. FAP+ pericyte-like cells were detected in collagen I- and fibronectin-rich areas in biopsy samples and produced considerably more collagen I and fibronectin in vitro compared to other cells in the glioblastoma microenvironment. Using mass spectrometry, we confirmed that 3D matrices produced by FAP+ pericyte-like cells were rich in collagen I, fibronectin, and various basement membrane proteins, showing a distinct profile from glioma cells. Furthermore, ECM produced by FAP+ pericyte-like...	en_US
dc.language	English	cs_CZ
dc.language.iso	en_US
dc.publisher	Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta	cs_CZ
dc.subject	Glioblastom	cs_CZ
dc.subject	Mozkové metastázy	cs_CZ
dc.subject	Fibroblastový aktivační protein	cs_CZ
dc.subject	Kolagen I	cs_CZ
dc.subject	Fibronektin	cs_CZ
dc.subject	Glioblastoma	en_US
dc.subject	Brain metastases	en_US
dc.subject	Fibroblast activation protein	en_US
dc.subject	Collagen I	en_US
dc.subject	Fibronectin	en_US
dc.title	Remodelling of Extracellular Matrix in Microenvironment of High Grade Gliomas and Brain Metastases	en_US
dc.type	dizertační práce	cs_CZ
dcterms.created	2025
dcterms.dateAccepted	2025-01-23
dc.description.department	Institute of Biochemistry and Experimental Oncology First Faculty of Medicine Charles University	en_US
dc.description.department	Ústav biochemie a experimentální onkologie 1. LF UK	cs_CZ
dc.description.faculty	1. lékařská fakulta	cs_CZ
dc.description.faculty	First Faculty of Medicine	en_US
dc.identifier.repId	219101
dc.title.translated	Remodelace extracelulární matrix v mikroprostředí gliomů o vysokém stupni malignity a mozkových metastáz	cs_CZ
dc.contributor.referee	Kolář, Zdeněk
dc.contributor.referee	Verreault, Maité
thesis.degree.name	Ph.D.
thesis.degree.level	doktorské	cs_CZ
thesis.degree.discipline	Biochemistry and Pathobiochemistry	en_US
thesis.degree.discipline	Biochemie a patobiochemie	cs_CZ
thesis.degree.program	Biochemistry and Pathobiochemistry	en_US
thesis.degree.program	Biochemie a patobiochemie	cs_CZ
uk.thesis.type	dizertační práce	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-cs	1. lékařská fakulta::Ústav biochemie a experimentální onkologie 1. LF UK	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-en	First Faculty of Medicine::Institute of Biochemistry and Experimental Oncology First Faculty of Medicine Charles University	en_US
uk.faculty-name.cs	1. lékařská fakulta	cs_CZ
uk.faculty-name.en	First Faculty of Medicine	en_US
uk.faculty-abbr.cs	1.LF	cs_CZ
uk.degree-discipline.cs	Biochemie a patobiochemie	cs_CZ
uk.degree-discipline.en	Biochemistry and Pathobiochemistry	en_US
uk.degree-program.cs	Biochemie a patobiochemie	cs_CZ
uk.degree-program.en	Biochemistry and Pathobiochemistry	en_US
thesis.grade.cs	Prospěl/a	cs_CZ
thesis.grade.en	Pass	en_US
uk.abstract.cs	Progrese mozkových nádorů způsobuje významné změny ve složení extracelulární matrix (ECM) mozku. Jednou z těchto změn je zvýšená exprese fibrilárních proteinů ECM. Proteiny jako kolagen I a fibronektin významně ovlivňují progresi mozkových nádorů a jejich exprese koreluje s horším stavem pacientů. Přesná role a buněčný původ těchto proteinů však stále zůstává neodhalena. V této disertační práci jsme se zaměřili na expresi a roli fibrilárních proteinů extracelulární matrix, jako je kolagen I a fibronektin, v mikroprostředí nejčastějších nádorů mozku, glioblastomu a mozkových metastáz. V případě glioblastomu jsme detekovali zvýšené hladiny těchto fibrilárních proteinů v oblastech s vyšší expresí fibroblastového aktivačního proteinu (FAP), který se v glioblastomu nachází především na buňkách podobných pericytům. FAP+ pericytům podobné buňky byly v bioptických vzorcích detekovány v oblastech bohatých na kolagen I a fibronektin a produkovaly podstatně více kolagenu I a fibronektinu in vitro ve srovnání s ostatními buňkami v mikroprostředí glioblastomu. Pomocí hmotnostní spektrometrie jsme potvrdili, že 3D extracelulární matrix vytvořené FAP+ pericytům podobnými buňkami jsou bohaté na kolagen I, fibronektin a další esenciální proteiny bazální membrány a vykazují odlišný expresní profil ve srovnání s...	cs_CZ
uk.abstract.en	The progression of brain tumors leads to substantial alterations in both the quantity and composition of extracellular matrix (ECM). One of the changes includes higher expression of fibrillar ECM proteins, such as collagen I and fibronectin, which strongly affect the progression of brain tumors and correlate with poor patient outcome. However, the cellular origin and exact role of fibrillar ECM proteins in brain tumors remains unclear. In this doctoral thesis, we aimed our work on the expression and role of collagen I and fibronectin in the microenvironment of the most common brain tumors, glioblastoma and brain metastases. In glioblastoma we identified that elevated levels of these fibrillar proteins were associated with the expression of fibroblast activation protein (FAP), mainly found in pericyte-like cells. FAP+ pericyte-like cells were detected in collagen I- and fibronectin-rich areas in biopsy samples and produced considerably more collagen I and fibronectin in vitro compared to other cells in the glioblastoma microenvironment. Using mass spectrometry, we confirmed that 3D matrices produced by FAP+ pericyte-like cells were rich in collagen I, fibronectin, and various basement membrane proteins, showing a distinct profile from glioma cells. Furthermore, ECM produced by FAP+ pericyte-like...	en_US
uk.file-availability	V
uk.grantor	Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta, Ústav biochemie a experimentální onkologie 1. LF UK	cs_CZ
thesis.grade.code	P
uk.publication-place	Praha	cs_CZ
uk.thesis.defenceStatus	O