Study of molecular mechanisms and pathophysiological aspects of aggressive lymphoma therapy focused on targeted apoptosis induction and/or cell cycle inhibition

Maláriková, Diana

Studium molekulárních mechanismů a patofyziologických aspektů terapie agresivních lymfomů zaměřené na cílenou indukci apoptózy a/nebo inhibici buněčného cyklu

dc.contributor.advisor	Klener, Pavel
dc.creator	Maláriková, Diana
dc.date.accessioned	2025-02-11T11:25:33Z
dc.date.available	2025-02-11T11:25:33Z
dc.date.issued	2025
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/20.500.11956/196510
dc.description.abstract	Agresivní podtypy B-non Hodgkinských lymfomů jsou charakterizovány deregulací buněčného cyklu a apoptózy z důvodu rekurentně se vyskytujících molekulárních a cytogenetických aberací, včetně zvýšené exprese D-cyklinů, amplifikace genů kódujících cyklin-dependentní kinázy a transkripční faktory (MYC), mutací a delecí důležitých regulátorů buněčného cyklu (RB1, TP53, CDKN2A) a aberantní exprese anti-apoptotických proteinů (BCL2). Společná inhibice cyklin-dependentní kinázy 4/6 palbociklibem spolu s inhibicí anti-apoptotických BCL2 proteinů pomocí BH3-mimetik (BCL2 inhibitor venetoklax, MCL1 inhibitor S63845 a BCL-XL inhibitor A11556463) představuje smysluplnou kombinaci pro léčbu B-NHL. Na experimenty bylo využito 20 buněčných linií lymfomu z buněk pláště a difúzního velkobuněčného lymfomu a 4 xenografty odvozené od pacientů s lymfomem buněk pláště po selhání chemoterapie či ibrutinibu, inhibitoru Brutonovy kinázy. Hladiny proteinů před a po léčbě byly stanoveny pomocí western blotu. Změny potenciálů na mitochondriální membráně a aktivita AKT byly změřeny JC-1 barvením a geneticky kódovaným fluorescentním AKT reportérem. Metabolické změny a náchylnost buněk k apoptóze před a po léčbě byli změřeny pomocí Seahorse XF analyzéru a BH3 profilování. Vybrané genetické aberace (mutace, genové delece či jiné aberace)...	cs_CZ
dc.description.abstract	Aggressive subtypes of B-cell non-Hodgkin lymphomas are characterized by deregulation of cell-cycle and apoptosis due to recurrent molecular and cytogenetic aberrations, including the overexpression of D-type cyclins, the amplification of cyclin-dependent kinases or transcription factors (MYC), mutations or deletions of important cell cycle regulators (RB1, TP53, CDKN2A) or the aberrant expression of anti-apoptotic proteins (BCL2). The combined inhibition of a cyclin-dependent kinase 4/6 by palbociclib and anti-apoptotic BCL2 proteins with respective BH3-mimetics represents reasonable treatment combination in experimental therapy of B- NHL. A panel of 20 mantle cell lymphoma (MCL) and diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) cell lines and 4 patient-derived xenograft (PDX) models derived from chemotherapy and/or ibrutinib-refractory MCL were used for in vitro and in vivo experiments, respectively. Protein levels before and after treatment were measured by western blotting. Changes in the mitochondrial membrane potential and activity of the AKT kinase were evaluated by JC-1 staining and a genetically encoded fluorescent AKT reporter (a fluorescence resonance energy transfer, FRET assay), respectively. Metabolic pathways and pro-apoptotic priming before and after exposure to the tested inhibitors were measured...	en_US
dc.language	English	cs_CZ
dc.language.iso	en_US
dc.publisher	Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta	cs_CZ
dc.subject	agresivní lymfom	cs_CZ
dc.subject	palbociklib	cs_CZ
dc.subject	venetoklax	cs_CZ
dc.subject	inhibitory cyklin-dependentních kináz	cs_CZ
dc.subject	BH3-mimetika	cs_CZ
dc.subject	aggressive lymphoma	en_US
dc.subject	palbociclib	en_US
dc.subject	venetoclax	en_US
dc.subject	cyclin-dependent kinase inhibitors	en_US
dc.subject	BH3-mimetics	en_US
dc.title	Study of molecular mechanisms and pathophysiological aspects of aggressive lymphoma therapy focused on targeted apoptosis induction and/or cell cycle inhibition	en_US
dc.type	dizertační práce	cs_CZ
dcterms.created	2025
dcterms.dateAccepted	2025-01-16
dc.description.department	Institute of Pathological Physiology First Faculty of Medicine Charles University	en_US
dc.description.department	Ústav patologické fyziologie 1. LF UK	cs_CZ
dc.description.faculty	1. lékařská fakulta	cs_CZ
dc.description.faculty	First Faculty of Medicine	en_US
dc.identifier.repId	172185
dc.title.translated	Studium molekulárních mechanismů a patofyziologických aspektů terapie agresivních lymfomů zaměřené na cílenou indukci apoptózy a/nebo inhibici buněčného cyklu	cs_CZ
dc.contributor.referee	Pytlík, Robert
dc.contributor.referee	Mráz, Marek
thesis.degree.name	Ph.D.
thesis.degree.level	doktorské	cs_CZ
thesis.degree.discipline	Human Physiology and Pathophysiology	en_US
thesis.degree.discipline	Fyziologie a patofyziologie člověka	cs_CZ
thesis.degree.program	Human Physiology and Pathophysiology	en_US
thesis.degree.program	Fyziologie a patofyziologie člověka	cs_CZ
uk.thesis.type	dizertační práce	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-cs	1. lékařská fakulta::Ústav patologické fyziologie 1. LF UK	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-en	First Faculty of Medicine::Institute of Pathological Physiology First Faculty of Medicine Charles University	en_US
uk.faculty-name.cs	1. lékařská fakulta	cs_CZ
uk.faculty-name.en	First Faculty of Medicine	en_US
uk.faculty-abbr.cs	1.LF	cs_CZ
uk.degree-discipline.cs	Fyziologie a patofyziologie člověka	cs_CZ
uk.degree-discipline.en	Human Physiology and Pathophysiology	en_US
uk.degree-program.cs	Fyziologie a patofyziologie člověka	cs_CZ
uk.degree-program.en	Human Physiology and Pathophysiology	en_US
thesis.grade.cs	Prospěl/a	cs_CZ
thesis.grade.en	Pass	en_US
uk.abstract.cs	Agresivní podtypy B-non Hodgkinských lymfomů jsou charakterizovány deregulací buněčného cyklu a apoptózy z důvodu rekurentně se vyskytujících molekulárních a cytogenetických aberací, včetně zvýšené exprese D-cyklinů, amplifikace genů kódujících cyklin-dependentní kinázy a transkripční faktory (MYC), mutací a delecí důležitých regulátorů buněčného cyklu (RB1, TP53, CDKN2A) a aberantní exprese anti-apoptotických proteinů (BCL2). Společná inhibice cyklin-dependentní kinázy 4/6 palbociklibem spolu s inhibicí anti-apoptotických BCL2 proteinů pomocí BH3-mimetik (BCL2 inhibitor venetoklax, MCL1 inhibitor S63845 a BCL-XL inhibitor A11556463) představuje smysluplnou kombinaci pro léčbu B-NHL. Na experimenty bylo využito 20 buněčných linií lymfomu z buněk pláště a difúzního velkobuněčného lymfomu a 4 xenografty odvozené od pacientů s lymfomem buněk pláště po selhání chemoterapie či ibrutinibu, inhibitoru Brutonovy kinázy. Hladiny proteinů před a po léčbě byly stanoveny pomocí western blotu. Změny potenciálů na mitochondriální membráně a aktivita AKT byly změřeny JC-1 barvením a geneticky kódovaným fluorescentním AKT reportérem. Metabolické změny a náchylnost buněk k apoptóze před a po léčbě byli změřeny pomocí Seahorse XF analyzéru a BH3 profilování. Vybrané genetické aberace (mutace, genové delece či jiné aberace)...	cs_CZ
uk.abstract.en	Aggressive subtypes of B-cell non-Hodgkin lymphomas are characterized by deregulation of cell-cycle and apoptosis due to recurrent molecular and cytogenetic aberrations, including the overexpression of D-type cyclins, the amplification of cyclin-dependent kinases or transcription factors (MYC), mutations or deletions of important cell cycle regulators (RB1, TP53, CDKN2A) or the aberrant expression of anti-apoptotic proteins (BCL2). The combined inhibition of a cyclin-dependent kinase 4/6 by palbociclib and anti-apoptotic BCL2 proteins with respective BH3-mimetics represents reasonable treatment combination in experimental therapy of B- NHL. A panel of 20 mantle cell lymphoma (MCL) and diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) cell lines and 4 patient-derived xenograft (PDX) models derived from chemotherapy and/or ibrutinib-refractory MCL were used for in vitro and in vivo experiments, respectively. Protein levels before and after treatment were measured by western blotting. Changes in the mitochondrial membrane potential and activity of the AKT kinase were evaluated by JC-1 staining and a genetically encoded fluorescent AKT reporter (a fluorescence resonance energy transfer, FRET assay), respectively. Metabolic pathways and pro-apoptotic priming before and after exposure to the tested inhibitors were measured...	en_US
uk.file-availability	V
uk.grantor	Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta, Ústav patologické fyziologie 1. LF UK	cs_CZ
thesis.grade.code	P
uk.publication-place	Praha	cs_CZ
uk.thesis.defenceStatus	O