Charakterizace hereditární komponenty u vysoce rizikových pacientek s gynekologickými tumory

Horáčková, Klára

Characterisation of hereditary factors in high-risk patients with gynecologic cancers

dc.contributor.advisor	Soukupová, Jana
dc.creator	Horáčková, Klára
dc.date.accessioned	2024-12-19T09:55:05Z
dc.date.available	2024-12-19T09:55:05Z
dc.date.issued	2024
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/20.500.11956/195995
dc.description.abstract	Mgr. Klára Horáčková Disertační práce: Charakterizace hereditární komponenty u vysoce rizikových pacientek s gynekologickými tumory ABSTRAKT Nádory ovaria (OC) jsou celosvětově u žen zodpovědné za téměř 5 % všech úmrtí způsobených nádorovými onemocněními. Více než polovina OC je diagnostikována v pokročilých stádiích spojených s nepříznivou prognózou (s pětiletým přežitím kolem 50 %). Průměrný věk v době diagnózy se pohybuje okolo 65 let. OC je charakteristické velkým podílem hereditárních tumorů; germinální patogenní/pravděpodobně patogenní varianta (GPV) v nádorových predispozičních genech je identifikována u více než 20 % pacientek. Z těchto pacientek však můžeme vyčlenit specifickou podskupinu s diagnózou OC s časným nástupem (<30 let), u kterých nacházíme atypicky nízký podíl hereditárních forem se záchytem GPV pod 10 %, a tedy nejasnou příčinou vzniku tohoto onemocnění. Předložená disertační práce se zabývá komplexní genetickou analýzou u pacientek s OC s časným nástupem s využitím celoexomového sekvenování na úrovni jak DNA, tak i RNA doplněného o analýzu polygenního skóre rizika (PRS) a typizace lidských leukocytárních antigenů (HLA). Ve skupině 123 pacientek s diagnózou OC do 30 let věku jsme identifikovali pouze 6 (4,9 %) nosiček GPV ve známých OC predispozičních genech. Výsledky dalších...	cs_CZ
dc.description.abstract	Mgr. Klára Horáčková Dissertation thesis: Characterisation of hereditary factors in high-risk patients with gynecologic cancers ABSTRACT Ovarian cancer (OC) accounts for less than 5% of all cancer-related deaths in women worldwide. More than half of OC patients are diagnosed at an advanced stages with an unfavorable prognosis (with a 5-year survival rate of around 50%). The mean age at diagnosis is around 65 years. Characteristics of OC include a high proportion of hereditary cancers - a germline pathogenic/likely pathogenic variant (GPV) in cancer predisposition genes is identified in more than 20% of cases. However, we can distinguish a specific subgroup of early- onset OC patients (<30 years), in whom an atypically low proportion of hereditary forms is identified with a GPV detection rate in established OC predisposition genes falling below 10%. Thus, the genetic predisposition to early-onset OC remains unclear. The hereby presented thesis focuses on a comprehensive genetic analysis of early-onset OC patients using whole-exome sequencing at both DNA and RNA levels, complemented by polygenic risk score (PRS) analysis and human leukocyte antigen (HLA) typing. In a cohort of 123 patients diagnosed with early-onset OC (<30 years), we identified only 6 (4.9%) GPV carriers in known OC predisposition genes....	en_US
dc.language	Čeština	cs_CZ
dc.language.iso	cs_CZ
dc.publisher	Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta	cs_CZ
dc.subject	hereditary cancer predisposition	en_US
dc.subject	ovarian cancer	en_US
dc.subject	whole exome sequencing	en_US
dc.subject	germline variants	en_US
dc.subject	polygenic risk score	en_US
dc.subject	human leukocyte antigen	en_US
dc.subject	survival analysis	en_US
dc.subject	hereditární nádorová predispozice	cs_CZ
dc.subject	karcinom ovaria	cs_CZ
dc.subject	celoexomové sekvenování	cs_CZ
dc.subject	zárodečné varianty	cs_CZ
dc.subject	skóre polygenního rizika	cs_CZ
dc.subject	lidské leukocytární antigeny	cs_CZ
dc.subject	analýza přežití	cs_CZ
dc.title	Charakterizace hereditární komponenty u vysoce rizikových pacientek s gynekologickými tumory	cs_CZ
dc.type	dizertační práce	cs_CZ
dcterms.created	2024
dcterms.dateAccepted	2024-11-28
dc.description.department	Institute of Biology and Medical Genetics First Faculty of Medicine Charles University and General University Hospital in Prague	en_US
dc.description.department	Ústav biologie a lékařské genetiky 1. LF UK a VFN	cs_CZ
dc.description.faculty	1. lékařská fakulta	cs_CZ
dc.description.faculty	First Faculty of Medicine	en_US
dc.identifier.repId	229762
dc.title.translated	Characterisation of hereditary factors in high-risk patients with gynecologic cancers	en_US
dc.contributor.referee	Stružinská, Ivana
dc.contributor.referee	Václavíková, Radka
thesis.degree.name	Ph.D.
thesis.degree.level	doktorské	cs_CZ
thesis.degree.discipline	Molecular and Cellular Biology, Genetics and Virology	en_US
thesis.degree.discipline	Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie	cs_CZ
thesis.degree.program	Molecular and Cellular Biology, Genetics and Virology	en_US
thesis.degree.program	Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie	cs_CZ
uk.thesis.type	dizertační práce	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-cs	1. lékařská fakulta::Ústav biologie a lékařské genetiky 1. LF UK a VFN	cs_CZ
uk.taxonomy.organization-en	First Faculty of Medicine::Institute of Biology and Medical Genetics First Faculty of Medicine Charles University and General University Hospital in Prague	en_US
uk.faculty-name.cs	1. lékařská fakulta	cs_CZ
uk.faculty-name.en	First Faculty of Medicine	en_US
uk.faculty-abbr.cs	1.LF	cs_CZ
uk.degree-discipline.cs	Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie	cs_CZ
uk.degree-discipline.en	Molecular and Cellular Biology, Genetics and Virology	en_US
uk.degree-program.cs	Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie	cs_CZ
uk.degree-program.en	Molecular and Cellular Biology, Genetics and Virology	en_US
thesis.grade.cs	Prospěl/a	cs_CZ
thesis.grade.en	Pass	en_US
uk.abstract.cs	Mgr. Klára Horáčková Disertační práce: Charakterizace hereditární komponenty u vysoce rizikových pacientek s gynekologickými tumory ABSTRAKT Nádory ovaria (OC) jsou celosvětově u žen zodpovědné za téměř 5 % všech úmrtí způsobených nádorovými onemocněními. Více než polovina OC je diagnostikována v pokročilých stádiích spojených s nepříznivou prognózou (s pětiletým přežitím kolem 50 %). Průměrný věk v době diagnózy se pohybuje okolo 65 let. OC je charakteristické velkým podílem hereditárních tumorů; germinální patogenní/pravděpodobně patogenní varianta (GPV) v nádorových predispozičních genech je identifikována u více než 20 % pacientek. Z těchto pacientek však můžeme vyčlenit specifickou podskupinu s diagnózou OC s časným nástupem (<30 let), u kterých nacházíme atypicky nízký podíl hereditárních forem se záchytem GPV pod 10 %, a tedy nejasnou příčinou vzniku tohoto onemocnění. Předložená disertační práce se zabývá komplexní genetickou analýzou u pacientek s OC s časným nástupem s využitím celoexomového sekvenování na úrovni jak DNA, tak i RNA doplněného o analýzu polygenního skóre rizika (PRS) a typizace lidských leukocytárních antigenů (HLA). Ve skupině 123 pacientek s diagnózou OC do 30 let věku jsme identifikovali pouze 6 (4,9 %) nosiček GPV ve známých OC predispozičních genech. Výsledky dalších...	cs_CZ
uk.abstract.en	Mgr. Klára Horáčková Dissertation thesis: Characterisation of hereditary factors in high-risk patients with gynecologic cancers ABSTRACT Ovarian cancer (OC) accounts for less than 5% of all cancer-related deaths in women worldwide. More than half of OC patients are diagnosed at an advanced stages with an unfavorable prognosis (with a 5-year survival rate of around 50%). The mean age at diagnosis is around 65 years. Characteristics of OC include a high proportion of hereditary cancers - a germline pathogenic/likely pathogenic variant (GPV) in cancer predisposition genes is identified in more than 20% of cases. However, we can distinguish a specific subgroup of early- onset OC patients (<30 years), in whom an atypically low proportion of hereditary forms is identified with a GPV detection rate in established OC predisposition genes falling below 10%. Thus, the genetic predisposition to early-onset OC remains unclear. The hereby presented thesis focuses on a comprehensive genetic analysis of early-onset OC patients using whole-exome sequencing at both DNA and RNA levels, complemented by polygenic risk score (PRS) analysis and human leukocyte antigen (HLA) typing. In a cohort of 123 patients diagnosed with early-onset OC (<30 years), we identified only 6 (4.9%) GPV carriers in known OC predisposition genes....	en_US
uk.file-availability	V
uk.grantor	Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta, Ústav biologie a lékařské genetiky 1. LF UK a VFN	cs_CZ
thesis.grade.code	P
dc.contributor.consultant	Kleiblová, Petra
uk.publication-place	Praha	cs_CZ
uk.thesis.defenceStatus	O