Zobrazit minimální záznam

Čas fixace v Moranově procesu při silné selekci
dc.contributor.advisorTkadlec, Josef
dc.creatorKopfová, Lenka
dc.date.accessioned2024-07-08T11:13:04Z
dc.date.available2024-07-08T11:13:04Z
dc.date.issued2024
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/190939
dc.description.abstractMoran process is a model used in evolutionary dynamics to study natural selection. In this process, a population of individuals evolves in steps. In one step a random individual is selected with probability proportional to its fitness and spreads to its randomly selected neighbor. The classical course of study is to consider an individual with a hereditary mutation and examine the fate of this mutation in time. This thesis investigates a modified version of the Moran process that corresponds to the strong selection, as in the dynamics of invasive species. In this process, only the mutant individuals spread and eventually conquer the whole population. The key quantity that we study is the so-called fixation time, which is the expected time until all individuals become mutants. We give tight upper and lower bounds for fixation time on a general population structure and refine them for some classes. Additionally, we compute the precise fixation times on some specific population structures.en_US
dc.description.abstractMoranův proces je model, který se používá v evoluční dynamice ke studiu přírozeného výběru. V tomto procesu máme populaci jedinců, která se vyvíjí v krocích. V jednom kroku je vybrán náhodný jedinec s pravděpodobností úměrnou své zdatnosti (fitness), a ten se rozšíří do svého náhodně vybraného souseda. Klasickým předmětem studia je uvažovat jedince s dědičnou mutací a zkoumat osud této mutace v čase. Tato práce se zabývá upravenou verzí Moranova procesu, která odpovídá silné selekci, tak jako je tomu například v dynamice invazivních druhů. V tomto procesu se rozmno- žují pouze mutantní jedinci, kteří nakonec ovládnou celou populaci. Klíčovou veličinou, kterou studujeme, je tzv. čas fixace, tedy očekáváná doba než se všichni jedinci stanou mutanty. V práci ukazujeme těsné horní a dolní odhady na čas fixace pro obecnou strukturu po- pulace a zlepšujeme je pro některé třídy. Kromě toho dokazujeme přesné doby fixace pro některé konkrétní struktury populace.cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.subjectevolutionary dynamics|Moran process|graphen_US
dc.subjectevoluční dynamika|Moranův proces|grafcs_CZ
dc.titleFixation time in Moran process under strong selectionen_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2024
dcterms.dateAccepted2024-06-14
dc.description.departmentComputer Science Institute of Charles Universityen_US
dc.description.departmentInformatický ústav Univerzity Karlovycs_CZ
dc.description.facultyMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Mathematics and Physicsen_US
dc.identifier.repId264644
dc.title.translatedČas fixace v Moranově procesu při silné selekcics_CZ
dc.contributor.refereeChatterjee, Krishnendu
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineInformatika - Diskrétní modely a algoritmycs_CZ
thesis.degree.disciplineComputer Science - Discrete Models and Algorithmsen_US
thesis.degree.programComputer Science - Discrete Models and Algorithmsen_US
thesis.degree.programInformatika - Diskrétní modely a algoritmycs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csMatematicko-fyzikální fakulta::Informatický ústav Univerzity Karlovycs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Mathematics and Physics::Computer Science Institute of Charles Universityen_US
uk.faculty-name.csMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Mathematics and Physicsen_US
uk.faculty-abbr.csMFFcs_CZ
uk.degree-discipline.csInformatika - Diskrétní modely a algoritmycs_CZ
uk.degree-discipline.enComputer Science - Discrete Models and Algorithmsen_US
uk.degree-program.csInformatika - Diskrétní modely a algoritmycs_CZ
uk.degree-program.enComputer Science - Discrete Models and Algorithmsen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csMoranův proces je model, který se používá v evoluční dynamice ke studiu přírozeného výběru. V tomto procesu máme populaci jedinců, která se vyvíjí v krocích. V jednom kroku je vybrán náhodný jedinec s pravděpodobností úměrnou své zdatnosti (fitness), a ten se rozšíří do svého náhodně vybraného souseda. Klasickým předmětem studia je uvažovat jedince s dědičnou mutací a zkoumat osud této mutace v čase. Tato práce se zabývá upravenou verzí Moranova procesu, která odpovídá silné selekci, tak jako je tomu například v dynamice invazivních druhů. V tomto procesu se rozmno- žují pouze mutantní jedinci, kteří nakonec ovládnou celou populaci. Klíčovou veličinou, kterou studujeme, je tzv. čas fixace, tedy očekáváná doba než se všichni jedinci stanou mutanty. V práci ukazujeme těsné horní a dolní odhady na čas fixace pro obecnou strukturu po- pulace a zlepšujeme je pro některé třídy. Kromě toho dokazujeme přesné doby fixace pro některé konkrétní struktury populace.cs_CZ
uk.abstract.enMoran process is a model used in evolutionary dynamics to study natural selection. In this process, a population of individuals evolves in steps. In one step a random individual is selected with probability proportional to its fitness and spreads to its randomly selected neighbor. The classical course of study is to consider an individual with a hereditary mutation and examine the fate of this mutation in time. This thesis investigates a modified version of the Moran process that corresponds to the strong selection, as in the dynamics of invasive species. In this process, only the mutant individuals spread and eventually conquer the whole population. The key quantity that we study is the so-called fixation time, which is the expected time until all individuals become mutants. We give tight upper and lower bounds for fixation time on a general population structure and refine them for some classes. Additionally, we compute the precise fixation times on some specific population structures.en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta, Informatický ústav Univerzity Karlovycs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV