Metody biomedicínské informatiky při studiu zánětlivých střevních onemocnění u dětí

Abstract

METODY BIOMEDICÍNSKÉ INFORMATIKY PŘI STUDIU ZÁNĚTLIVÝCH STŘEVNÍCH ONEMOCNĚNÍ U DĚTÍ Abstrakt Zánětlivá střevní onemocnění (IBD) představují skupinu chronických, polygenně podmíněných onemocnění postihujících primárně gastrointestinální trakt, jejichž incidence v dospělé i dětské populaci globálně narůstá. Mezi tyto nemoci řadíme Crohnovou nemoc (CD), ulcerózní kolitidu (UC) a tzv. neklasifikovatelné IBD (IBD-U). Fekální kalprotektin (FC) je markerem zánětu u IBD a jeho hladiny korelují s aktivitou onemocnění definovanou klinickými parametry, endoskopickým nálezem a histologií. Současná lékařská praxe je spojena s dostupností velkého množství klinických dat a snahou jejich efektivního uplatnění v procesu medicínskeho rozhodování takovým způsobem, aby bylo dosaženo maximální možné redukce rizika nepříznivého průběhu onemocnění a výskytu s onemocněním a/nebo léčbou asociovaných komplikací. Primárním cílem disertační práce je využití metod biomedicínské informatiky v oblasti pediatrických IBD v procesu ověření FC v predikci aktivity onemocnění a odpovědi na léčbu, hledání dalších potencionálních prediktivních faktorů a tvorbu predikčních modelů pro konkrétní klinické situace. Zjistili jsme, že na základě vývoje hladin FC v časné fazi indukční léčby pomocí výhradní enterální výživy nelze rozhodovat o dalším...

METHODS OF BIOMEDICAL INFORMATICS IN THE STUDY OF INFLAMMATORY BOWEL DISEASE IN CHILDREN Abstract Inflammatory bowel diseases (IBD) are a group of chronic, polygenic diseases primarily affecting the gastrointestinal tract, with an increasing incidence in both adult and paediatric populations globally. These diseases include Crohn's disease (CD), ulcerative colitis (UC) and so-called IBD unclassified (IBD-U). Faecal calprotectin (FC) is a marker of inflammation in IBD and its levels correlate with disease activity as defined by clinical parameters, endoscopic findings and histology. Current medical practice is associated with the availability of a large amount of clinical data and the desire to apply it effectively in the medical decision-making process in such a way as to achieve the maximum possible reduction in the risk of adverse disease course and the occurrence of disease- and/or treatment-associated complications. The primary goal of this dissertation is to apply biomedical informatics methods to paediatric IBD in the process of validating FC in predicting disease activity and response to treatment, searching for additional potential predictive factors, and developing prediction models for specific clinical situations. We found that the development of FC levels in the early phase of induction therapy...