Nástroj pro průzkum a vizualizaci modelu pro simulátor mozku Mozaik

Abstract

Simulations of biological neural networks are an important tool for under- standing how the brain processes information. Mozaik is a workflow frame- work that allows such simulations to be created, run and analyzed. Currently, however, there is no easy way to visualize in it either the network or the data structures created by individual analyses. This work is a web application that allows users to visualize networks and data structures stored in data- stores for individual simulations. The given visualizations can be searched using complex queries, interactively examined and compared with each other. This makes the work of researchers working with the Mozaik framework much more efficient.

Simulace biologických neuronových sítí jsou důležitým nástrojem pro po- rozumění tomu, jak mozek zpracovává informace. Mozaik je workflow fra- mework, který umožňuje takové simulace vytvářet, spouštět a analyzovat. V současné době ale neexistuje snadný způsob, jak v něm vizualizovat ani síť, ani datové struktury vytvořené jednotlivými analýzami. Tato práce je webová aplikace, která umožňuje vizualizovat sítě a datové struktury ulo- žené v datastorech pro jednotlivé simulace. Dané vizualizace lze vyhledávat pomocí komplexních dotazů, interaktivně je zkoumat a vzájemně mezi sebou srovnávat. To výrazně zefektivňuje práci výzkumníků, kteří s frameworkem Mozaik zacházejí.