dc.contributor.advisor | Hrabák, Jaroslav | |
dc.creator | Šrámková, Anna | |
dc.date.accessioned | 2021-09-06T18:07:13Z | |
dc.date.available | 2021-09-06T18:07:13Z | |
dc.date.issued | 2018 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/103120 | |
dc.description.abstract | Currently, the development of bacterial resistance is one of the major healthcare problems. Especially, the significant continuous increase of carbapenem-resistant Gram-negative bacteria, which most often affected seriously ill hospitalized patients, is a cause for great concern. Worldwide dissemination of carbapenemase-encoding genes is largely associated with mobile genetic elements and the clonal spread of high-risk clones. The dissertation thesis is focused on a molecular-epidemiological mapping of carbapenemase-positive Gram-negative isolates detected in hospital settings throughout the Czech Republic. Since 2015, a significant increase of carbapenemase-producing Enterobacteriaceæ (CPE) was detected in our country, mainly attributed to the dissemination of OXA-48 and NDM enzymes. Studies focusing on the first big outbreaks as well as sporadic cases of OXA-48 and NDM carbapenemases were performed. Results showed that blaOXA-48-carrying plasmids, which are derivatives of the archetypal IncL plasmid pOXA-48 originally described in Turkey, play a major role in the dissemination of OXA-48 enzymes in Czech hospitals. This finding is in agreement with the data from previous studies reported worldwide. The study of NDM-positive isolates revealed that IncX3 plasmids are the main factor contributing to the... | en_US |
dc.description.abstract | Rozvoj a šíření antibiotické rezistence představuje jeden z nejzávažnějších medicínských problémů současnosti. Pokračující vzestup incidence karbapenem-rezistentních gramnegativních izolátů, které často postihují vážně stonající pacienty, je reálným důvodem k obavám. Celosvětová diseminace karbapenemáz je významně spojena s přenosem genů rezistence prostřednictvím mobilních genetických elementů a klonálním šíření epidemiologicky úspěšných kmenů. Zaměřením této disertační práce je molekulárně-epidemiologická analýza gramnegativních karbapene- máza-pozitivních kmenů zachycených v nemocnicích na území České republiky. Od roku 2015 byl v České republice zaznamenán signifikantní nárůst incidence karbapenemáza-pozi- tivních Enterobacteriaceæ (CPE), převážně způsobený rozšířením enzymů OXA-48 a NDM. Podařilo se nám zmapovat první velké epidemické epizody a sporadické izoláty detekované v ČR. Výsledky studie zaměřená na enzymy OXA-48-like prokázaly, že plasmidy nesoucí gen blaOXA-48, které byly identifikovány jako deriváty archetypálního IncL plazmidu původně detekovaného v Turecku, hrají hlavní roli v šíření enzymu OXA-48 v českých nemocnicích. Toto zjištění je ve shodě s výsledky publikací z ostatních zemí světa. Studie zabývající se NDM-pozitivními izoláty prokázala, že IncX3 enzymy představují hlavní... | cs_CZ |
dc.language | English | cs_CZ |
dc.language.iso | en_US | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Lékařská fakulta v Plzni | cs_CZ |
dc.title | Molecular epidemiological analysis of carbapenem resistant isolates of Enterobacteriaceae and Pseudomonas spp. | en_US |
dc.type | dizertační práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2018 | |
dcterms.dateAccepted | 2018-09-26 | |
dc.description.department | Ústav mikrobiologie | cs_CZ |
dc.description.faculty | Lékařská fakulta v Plzni | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Medicine in Pilsen | en_US |
dc.identifier.repId | 160241 | |
dc.title.translated | Molekulárně-epidemiologická analýza izolátů z čeledi enterobakteriaceae a rodu pseudomonas rezistentní ke karbapenenům | cs_CZ |
dc.contributor.referee | Kolář, Milan | |
dc.contributor.referee | Gniadkowski, Marek | |
dc.identifier.aleph | 002206576 | |
thesis.degree.name | Ph.D. | |
thesis.degree.level | doktorské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | - | en_US |
thesis.degree.discipline | - | cs_CZ |
thesis.degree.program | Hygiene, Preventive Medicine and Epidemiology | en_US |
thesis.degree.program | Hygiena, preventivní lékařství a epidemiologie | cs_CZ |
uk.thesis.type | dizertační práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Lékařská fakulta v Plzni::Ústav mikrobiologie | cs_CZ |
uk.faculty-name.cs | Lékařská fakulta v Plzni | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Medicine in Pilsen | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | LFP | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | - | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | - | en_US |
uk.degree-program.cs | Hygiena, preventivní lékařství a epidemiologie | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Hygiene, Preventive Medicine and Epidemiology | en_US |
thesis.grade.cs | Prospěl/a | cs_CZ |
thesis.grade.en | Pass | en_US |
uk.abstract.cs | Rozvoj a šíření antibiotické rezistence představuje jeden z nejzávažnějších medicínských problémů současnosti. Pokračující vzestup incidence karbapenem-rezistentních gramnegativních izolátů, které často postihují vážně stonající pacienty, je reálným důvodem k obavám. Celosvětová diseminace karbapenemáz je významně spojena s přenosem genů rezistence prostřednictvím mobilních genetických elementů a klonálním šíření epidemiologicky úspěšných kmenů. Zaměřením této disertační práce je molekulárně-epidemiologická analýza gramnegativních karbapene- máza-pozitivních kmenů zachycených v nemocnicích na území České republiky. Od roku 2015 byl v České republice zaznamenán signifikantní nárůst incidence karbapenemáza-pozi- tivních Enterobacteriaceæ (CPE), převážně způsobený rozšířením enzymů OXA-48 a NDM. Podařilo se nám zmapovat první velké epidemické epizody a sporadické izoláty detekované v ČR. Výsledky studie zaměřená na enzymy OXA-48-like prokázaly, že plasmidy nesoucí gen blaOXA-48, které byly identifikovány jako deriváty archetypálního IncL plazmidu původně detekovaného v Turecku, hrají hlavní roli v šíření enzymu OXA-48 v českých nemocnicích. Toto zjištění je ve shodě s výsledky publikací z ostatních zemí světa. Studie zabývající se NDM-pozitivními izoláty prokázala, že IncX3 enzymy představují hlavní... | cs_CZ |
uk.abstract.en | Currently, the development of bacterial resistance is one of the major healthcare problems. Especially, the significant continuous increase of carbapenem-resistant Gram-negative bacteria, which most often affected seriously ill hospitalized patients, is a cause for great concern. Worldwide dissemination of carbapenemase-encoding genes is largely associated with mobile genetic elements and the clonal spread of high-risk clones. The dissertation thesis is focused on a molecular-epidemiological mapping of carbapenemase-positive Gram-negative isolates detected in hospital settings throughout the Czech Republic. Since 2015, a significant increase of carbapenemase-producing Enterobacteriaceæ (CPE) was detected in our country, mainly attributed to the dissemination of OXA-48 and NDM enzymes. Studies focusing on the first big outbreaks as well as sporadic cases of OXA-48 and NDM carbapenemases were performed. Results showed that blaOXA-48-carrying plasmids, which are derivatives of the archetypal IncL plasmid pOXA-48 originally described in Turkey, play a major role in the dissemination of OXA-48 enzymes in Czech hospitals. This finding is in agreement with the data from previous studies reported worldwide. The study of NDM-positive isolates revealed that IncX3 plasmids are the main factor contributing to the... | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Lékařská fakulta v Plzni, Ústav mikrobiologie | cs_CZ |
thesis.grade.code | P | |
dc.contributor.consultant | Papagiannitsis, Constantinos | |
uk.publication-place | Plzeň | cs_CZ |
uk.thesis.defenceStatus | O | |
dc.identifier.lisID | 990022065760106986 | |