http://hdl.handle.net/20.500.11956/1932 Theses Wed, 27 May 2026 13:07:16 GMT 2026-05-27T13:07:16Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/207971 Aplikace biomolekulární spektroskopie při analýze buněk Aplikace biomolekulární spektroskopie při analýze buněk Jiří Bufka Abstrakt Disertační práce se zabývá aplikací biomolekulární spektroskopie při analýze buněk a jejím potenciálem pro klinické využití, zejména v pediatrii. Úvodní část shrnuje principy a metodologické aspekty různých spektroskopických metod (Ramanova spektroskopie, Fourierova transformovaná infračervená spektroskopie, nukleární magnetická rezonance, fluorescenční spektroskopie a Ramanova optická aktivita), jejich výhody, limity a současné trendy v biomedicínském výzkumu. Hlavní část práce je koncipována jako soubor publikací dokumentujících posun biomolekulární spektroskopie od základního výzkumu k translačním a klinickým aplikacím. V rámci dětské gastroenterologie byla Ramanova spektroskopie využita k detailnímu molekulárnímu profilování žaludeční sliznice zdravých i Helicobacter pylori infikovaných dětí, přičemž byly identifikovány spektrální biomarkery reflektující oxidační stres, apoptózu a remodelaci tkáně. Další práce zdůrazňují význam Ramanovy spektroskopie v onkologii a hematologii, její schopnost monitorovat odpověď na cílenou léčbu a možnosti využití v dalších klinických oborech. Zvláštní pozornost byla věnována karotenoidům jako významným antioxidantům s charakteristickou vibrační signaturou využitelnou pro neinvazivní sledování...; Application of biomolecular spectroscopy in cell analysis Jiří Bufka Summary This dissertation focuses on the application of biomolecular spectroscopy in cell analysis and its potential for clinical implementation, with particular emphasis on pediatric medicine. The introductory part summarizes the principles and methodological aspects of key spectroscopic techniques (Raman spectroscopy, FTIR, NMR, fluorescence spectroscopy, and Raman optical activity), highlighting their strengths, limitations, and current trends in biomedical research. The core of the thesis is structured as a collection of publications documenting the transition of biomolecular spectroscopy from basic research to translational and clinical applications. In pediatric gastroenterology, Raman spectroscopy was employed for detailed molecular profiling of gastric mucosa in both healthy children and those infected with Helicobacter pylori, revealing spectral biomarkers associated with oxidative stress, apoptosis, and tissue remodeling. Additional studies emphasize the role of Raman spectroscopy in oncology and hematology, demonstrating its capacity to monitor responses to targeted therapies, as well as in clinical medicine. Particular attention was given to carotenoids as crucial antioxidants with distinctive vibrational signatures suitable... Thu, 01 Jan 2026 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/20.500.11956/207971 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/207722 Neurobiologie násilného chování Cíl: Tato disertační práce zkoumá vztah mezi složením střevního mikrobiomu a impulzivním a impulzivně násilným chováním. Cílem bylo ověřit, zda existují specifické bakteriální rody a druhy spojené s vyšší mírou impulzivity, zda raný vývoj mikrobiálního osídlení ovlivňuje pozdější behaviorální charakteristiky jedince a zda lze probioticky ovlivnit již existující impulzivní nebo impulzivně násilné chování. Metody: Práce zahrnuje tři vzájemně propojené části: (1) systematickou rešerši publikovanou v Behavioural Brain Research (2022), která analyzovala 21 humánních studií hodnotících souvislost mikrobiomu a raných faktorů vývoje mikrobioty s impulzivním a násilným chováním; (2) originální observační studii publikovanou v Neuropsychobiology (2024), v níž byl analyzován střevní mikrobiom, hladiny neurotransmiterů a mastných kyselin s krátkým řetězcem (SCFA) u 33 impulzivně násilných a 20 neimpulzivních žen odsouzených ve věznici v Opavě; a (3) aktualizovanou systematickou rešerši poublikovanou v České a slovenské psychiatrii (2025) zahrnující 12 nových studií zaměřených na vliv složení střevního mikrobiomu na impulzivní a impulzivně násilné chování, včetně studií zkoumajících probiotické a synbiotické intervence. Výsledky: Systematické rešerše potvrdily existenci souvislosti mezi střevní mikrobiotou a...; Objective: This dissertation investigates the relationship between gut microbiome composition and impulsive as well as impulsively violent behaviour. The aim was to determine whether specific bacterial genera and species are associated with higher levels of impulsivity, whether early development of microbial colonization influences later behavioural characteristics of the individual, and whether existing impulsive or impulsively violent behaviour can be modulated through probiotic intervention. Methods: The thesis comprises three interconnected parts: (1) a systematic review published in Behavioural Brain Research (2022), which analysed 21 human studies examining the relationship between the microbiome, early-life factors shaping microbiota development and impulsive or violent behaviour; (2) an original observational study published in Neuropsychobiology (2024), which analysed gut microbiome composition, neurotransmitter levels, and short-chain fatty acids (SCFAs) in 33 impulsively violent and 20 non-impulsive female inmates from Opava Prison; and (3) an updated systematic review published in Czech and Slovak psychiatry (2025) including 12 newly published studies focused on the influence of gut microbiome composition on impulsive and impulsively violent behaviour, including those exploring... Thu, 01 Jan 2026 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/20.500.11956/207722 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/202130 Vliv implicitních představ o zdraví a nemoci na zdravotní chování: psychiatrizace problémů každodenního života The dissertation is a compilation of six studies exploring the effect of implicit beliefs about mental disorders on its prevalence and subjective experience and the cultural factors that shape these beliefs. The current state of research and the aims of the dissertation are briefly introduced in the opening chapter and elaborated in the overview of individual studies, each of which includes a summary of methods and findings of the given study. Following a brief introduction outlining the theoretical foundations, the first study examines the cognitive factors that shape human suffering through the belief in having a mental disorder. Through expert interviews, we arrive at a definition of the reification of mental illness, which we argue constitutes a cognitive engine of psychiatrization. The next chapter presents a review article on psychiatrization, which also serves as the theoretical discussion of psychiatrization that underlies the three subsequent empirical studies. The first of these is a vignette study demonstrating the dimensions of psychiatrization over the past two centuries, with the discussion section outlining its risks for both the experience and the prevalence of mental illness. In the following two studies, we employ computational linguistic methods to quantify cultural changes that...; Práce je kompilátem šesti studií pojednávajících o vlivu implicitních představ o duševních onemocněních na jejich prevalenci a prožívání, resp. kulturních faktorech, které tyto představy formují. Popis současného stavu poznání a cíle práce jsou stručně nastíněny v úvodní kapitole a posléze popsány v přehledu jednotlivých studií, jejichž popisy také zahrnují shrnutí použitých metod a výsledků. Po krátkém úvodu představujícím teoretická východiska práce následuje studie o kognitivních faktorech, které formují lidské utrpení v přesvědčení o postižení duševní poruchou: Analýzou expertních rozhovorů dospíváme k definici reifikace duševních onemocnění, která je podle našeho názoru kognitivním motorem psychiatrizace. Následuje shrnutí přehledové studie o psychiatrizaci, které zároveň slouží jako teoretické ukotvení konceptu psychiatrizace, z něhož vychází následující tři empirické studie. První z nich je vinětová studie demonstrující rozměry psychiatrizace v posledních dvou staletích, v jejíž diskusi zároveň shrnujeme rizika psychiatrizace pro prožívání a prevalenci duševních onemocnění. V dalších dvou studiích užíváme metody výpočetní lingvistiky ke kvantifikaci kulturních změn, které tvoří kulturní aspekt psychiatrizace. Dokládáme v nich, že se chápání nechtěných lidských emocí a vlastností (např.... Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/20.500.11956/202130 2025-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/205187 Identifikace a funkční charakteristika nádorových prognostických a prediktivních genetických biomarkerů v experimentálních modelech a u pacientů se solidními nádory Although the quality of oncology care has been continuously improving over the last decade-from early diagnosis to the selection of effective treatments-late detection of cancerous growths is still not uncommon, particularly in the abdominal cavity. Additionally, resistance to administered treatments often arises, leading to the deterioration of the patient's condition and possibly even death. In recent years, reliable biomarkers have been regarded as a promising avenue that could enable both reliable and early diagnosis, as well as the selection of anti-cancer treatments tailored to the specific needs of the patient, thus addressing the unique nature of each cancer case. This dissertation thesis focuses on the research of potential prognostic and predictive biomarkers that would allow for a personalized approach to oncology patients, particularly in the cases of kidney, ovarian, and pancreatic tumors. Furthermore, the dissertation explores the testing of new potential compounds for the treatment of these mentioned cancers. The main results of this work include: 1) Introducing in vivo pancreatic cancer models for the study of new therapeutic regimens; 2) Third-generation taxanes SB-T-121605 and SB-T-121606 are effective in pancreatic ductal adenocarcinoma; 3) Association of long non-coding RNA and...; Přestože v posledním desetiletí dochází k neustálému zvyšování kvality onkologické péče, od včasné diagnózy, až po výběr účinné léčby, stále není výjimkou pozdní identifikace nádorového bujení, zejména v oblasti dutiny břišní, a vznik resistence na podávanou léčbu, vedoucí ke zhoršení stavu pacienta, případně až ke smrti. Spolehlivé biomarkery jsou v posledních letech vnímány jako slibná cesta, která by umožnila jak spolehlivou a včasnou diagnózu, tak výběr protinádorové léčby, která by odpovídala specifickým potřebám pacienta, a tedy i reagovala na unikátnost jeho nádorového onemocnění. Tato disertační práce se zabývá právě výzkumem potenciálních prognostických a prediktivních biomarkerů, které by umožnily personalizovaný přístup k onkologickým pacientům, a to zejména u nádorů ledvin, ovarií a pankreatu. Dále je tato práce zaměřena na testování nových potenciálních látek pro léčbu zmíněných nádorových onemocnění. Mezi hlavní výsledky této práce patří: 1) Vývoj in vivo modelů karcinomu pankreatu pro studium nových terapeutických režimů; 2) Stanovení účinnosti taxanů třetí generace SB-T-121605 a SB-T-121606 u duktálního adenokarcinomu pankreatu; 3) Asociace dlouhých nekódujících RNA a kódujícího transkriptomu s odpovědí na cílenou terapii u metastatického světlobuněčného karcinomu ledvin; 4) Profily... Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/20.500.11956/205187 2025-01-01T00:00:00Z